Begrepet genotype refererer til den totale genetiske sammensetningen av en organisme. Det brukes også til å beskrive de forskjellige variasjonene av et gen, kjent som alleler. Mennesker har to alleler for hver genetiske posisjon, eller lokus. Tilsammen blir hvert par alleler betraktet som en spesifikk genotype.
Å kjenne genotypen eller et genotypeeksempel på et individ kan være viktig for å forstå genetisk uttrykk, diagnostisere sykdommer, lære om genetiske mutasjoner og mer.
Genotype Definisjon
La oss starte med en spesifikk definisjon av genotype. En individers genotype er arvelig genetisk informasjon som personen har. Dette refererer til gener, DNA, alleler osv. I ett altomfattende ord. Et eksempel kan være å beskrive en blomsterfargenotyp som RR (som betyr at de har to "røde" alleler, RR, for deres farge) eller Rr (en "rød" allel, R og en "rosa" allel, r, for farge) .
Fenotypen din, derimot, er hva og individuelt fysisk viser som bestemmes av genotypen de har. Mens to individer kan ha samme fenotype, kan de ha helt forskjellige genotyper. Etter blomseeksemplet fra tidligere, ser både RR- og Rr-blomstene ut til å være røde fordi rødt er dominerende over rosa. Imidlertid er de forskjellige i sin genotype siden en er homozygot (RR) og en er heterozygot (Rr).
Les mer om definisjonen, alleler og eksempler på genotyper.
Å kjenne genotypen: Punnett Square
Et Punnett-torg er en av de enkleste måtene å bestemme genotype. Torget er faktisk et minikart som brukes til å bestemme den potensielle genotypen for et avkom med hensyn til bestemt trekk.
For å lage en Punnett-firkant, skriv alle mulige alleler over toppen av firkanten for en av foreldrene og alle mulige alleler for den andre foreldrene på venstre side. Hver oppførte allel blir enten en kolonne for øverste alleler eller en rad for venstre alleler, inne i firkanten. Ruten fylles ut når du skriver ned alleler fra toppen i deres respektive kolonner og deretter skriv ned alleler fra siden i sine respektive rader, og skape en firkant full av potensial genotyper.
Et genotypeeksempel ved bruk av Punnett-torget er de klassiske erteksperimentene utført av Gregor Mendel. Sjekk ut spesifikke genotype eksempler og Punnett firkanter her.
Polymerase kjedereaksjon
Utviklet i løpet av 1980-tallet, genererer polymerasekjedereaksjon (PCR) et spesifikt DNA-stativ basert på en malstreng. I tillegg til en malstreng er DNA-polymerase, nukleotider og korte biter av enkeltstrenget DNA nødvendig for en PCR-reaksjon.
På et bestemt tidspunkt begynner PCR-reaksjonen å generere kopier eksponentielt, og bare i løpet av denne fasen er det mulig å bestemme den opprinnelige mengden av målsekvensen i prøven. Metoden brukes til sekvensering, kloning og gentekniske formål.
Les mer om forskjellene mellom PCR-kloning.
Hybridiseringsprobe
En hybridiseringsprobe brukes til å bestemme om en fysisk egenskap skyldes genotype. Prosessen begynner med fullstendig fordøyelse av DNA som skal analyseres, etterfulgt av overføring til en filtermembran. Deretter tilsettes sonden til filteret og får bindes til en målsekvens.
Etter ca. 24 timer vaskes filteret for å fjerne enhver ikke-bundet sonde. En hybridiseringsprobe kan også brukes til å bestemme effektiviteten av en kloningsprosess eller finne ut antall kopier av et spesifikt gen.
Direkte DNA-sekvensering
Human Genome Project førte til utviklingen av en rekke kraftige DNA-sekvenseringsverktøy. I tillegg til å dekode hele genomet Homo sapienshar disse verktøyene tillatt forskere å sekvensere hele genomene til mange andre organismer, inkludert mus, rotter og ris. Toppmoderne sekvenseringsverktøy gjør at dagens genetikere kan sammenligne og manipulere store mengder DNA raskt og billig.
Dette vil gjøre det mulig å bestemme genetikkens rolle i sykdomsfølsomhet, den genetiske responsen til organismer miljømessige stimuli og spore utviklingen av et trekk eller en art, ifølge National Human Genome Research Institutt.