DNA har mange reparasjonsveier. Man må forekomme i lyset, og flere kan forekomme i mørket. Disse mekanismene kjennetegnes ved om enzymene som kreves for å utføre handlingene får energi fra solen.
To baser av DNA kan bli tverrbundet i nærvær av UV-lys. Denne tverrbindingen forhindrer at en rekke cellulære prosesser oppstår, inkludert DNA-replikasjon.
I lysreparasjon spalter et enzym kalt fotolyase tverrbundet DNA forårsaket av UV-skade. Fotolase krever solens energi.
Mørke reaksjoner bruker et enzym kalt N-glykosylase for å spalte tverrbindinger i DNA. Spesielt krever N-glykosylase ikke energi fra solen.
Rekombinasjonsreparasjon er også en DNA-reparasjonsmekanisme som ikke krever lys. DNA-replikasjonsmaskineri kan ikke replikere på tvers av tverrbundne DNA-baser. Det kan imidlertid hoppe over, og etterlate et gap. Dette gapet kan fylles av det motsatte kromosomet etter replikasjon, men før celledeling har skjedd. Denne prosessen er kjent som homolog rekombinasjon og krever ikke lys.
Eksisjon reparasjon oppstår når tverrbundne basepar blir gjenkjent av et proteinkompleks som fjerner flere baser som strekker seg før og etter tverrbindingen. Etter fjerning replikeres DNA korrekt ved å bruke den ikke-forvrengte strengen som mal.