HPLC (høyytelses væskekromatografi) og GC (gasskromatografi) er begge metodeforskere bruke til å analysere prøver for å bestemme hva prøven inneholder eller konsentrasjonen av molekyler i prøve. Begge bruker det samme prinsippet om at tyngre molekyler vil eluere eller strømme saktere enn lettere (polaritet spiller også en rolle i elueringstiden). Selv om ideen er den samme, har GC og HPLC flere forskjeller.
Mobilfasen
Den mobile fasen av kromatografiutstyr er stoffet som beveger prøven gjennom maskinen. I HPLC er den mobile fasen en væske som består av et organisk løsningsmiddel, ultrarent vann og andre ingredienser for å sikre dets kompatibilitet med prøven. GC bruker gass i sin mobile fase. Gassene som brukes inkluderer helium, nitrogen, argon eller hydrogen, avhengig av hva som blir analysert.
Kolonnene
Når prøvene beveger seg over kromatografikolonner, samhandler prøven og den mobile fasen med kolonneinnholdet og får komponentene i prøven til å elueres til forskjellige tidspunkter. HPLC-kolonner er vanligvis fire til seks tommer lange metall- eller glassrør tett pakket med silisiumdioksyd eller forskjellige karbonkjedelengder. GC-systemer har kveilede kapillarsøyler med innvendige vegger belagt med forskjellige materialer, avhengig av laboratoriets behov. Strukket ut, GC-kolonner kan nå lengder på 100 fot.
Prøvene
GC brukes til flyktige forbindelser (de som brytes ned raskt) mens HPLC er bedre for mindre flyktige prøver. Hvis en prøve inneholder salter eller bærer en ladning, må den analyseres ved hjelp av HPLC, ikke GC.
Temperatur kontroll
GC-kolonner ligger i en ovn i maskinen. En datamaskin endrer temperaturen mens prøver analyseres. Jo høyere temperatur, desto raskere eluerer prøven, men for høye temperaturer gir dårlige resultater. HPLC-kolonner holdes til enhver tid ved en stabil temperatur (oftest romtemperatur).