Seks underarter av mulehjort bor i omtrent 88.000 kvadratkilometer eller litt over halvparten av Californias land. De colombianske svart-hjort hjortene, Rocky Mountain muldyr hjort og California muldyr hjort ligger i spredte habitater over statens nordlige fylker. Alle seks underarter ser veldig like ut med bare små forskjeller i pelsfarge og markeringer.
Columbian Black-Tailed Deer
Columbian black-tailed hjort er de mest utbredte underarter i California. De forekommer i store deler av Nord-California, i kystområder fra Oregon-grensen til Santa Barbara-fylket og innover til den vestlige skråningen av Cascade-Sierra Nevada Range. Noen av disse populasjonene er trekkende, tilbringer somre i fjellet og vintre i lavere høyder. Andre, spesielt de nær kysten, er innbyggere året rundt. I samsvar med navnet deres har colombiansk svart-tailed hjort helt svarte haler og en relativt liten rumpe
Rocky Mountain Mule Deer
Rocky Mountain mule hjort, den tredje mest utbredte underarten i staten, forekommer hovedsakelig øst for Cascade-Sierra Nevada Range i fylkene Lassen, Shasta, Siskiyou og Modoc. De tilbringer vanligvis vintre i Great Basin Desert og spiser på bitterbørste og sagebrush. Om sommeren reiser de oppover 50 luft miles til høyhøydeområder i fjellet. Rocky Mountain muldyrhjort er blant de største av underartene og har som regel de største gevirene. De har en stor, hvit romplekk og en hale som bare er svart på tuppen.
California Mule Deer
Den nest mest utbredte underarten i staten, mulehjortet i California, strekker seg langs den vestlige skråningen av Sierra Nevada, så vel som i fjellene San Bernardino, San Gabriel og Tehachapi. Både bosatt og trekkende befolkning forekommer. Mulehjort i California har en større rumpeplaster og mindre svart på halen enn den colombianske svart-tailed hjorten. Det kan se ut som halen har en svart strek som løper. De forveksles ofte med sørlige mulehjort, som har en betydelig større stripe svart.
Hybrider
Fordi de er den samme arten, kan og kan Californias underarter av muldyrhjort lett krysse når de kommer i kontakt med hverandre. I kystområder sør for San Francisco Bay-området hybridiserer muldyrhjul i California mye med colombiansk svart-tailed hjort.