Alle dyr er kategorisert etter et syv-delt klassifiseringssystem. Hvilken type dyr en blekksprut er, avhenger av det taksonomiske nivået som diskuteres. Det bredeste nivået er rike, etterfulgt av fylum, klasse, orden, familie, slekt og art. Alle blekksprut tilhører ordenen Octopoda. Blekksprut er en del av klassen Cephalopoda, noe som betyr at blekksprut er blækspruter. Cephalopoda er en del av fylket Mollusca, noe som betyr at blekksprut også er bløtdyr.
Klasse: Cephalopoda
Blekksprut er blæksprutter. Cephalopods er preget av flere armer eller tentakler, store hoder og symmetriske kropper. Alle blekkspruter lever i saltvann. De er delt inn i to underklasser. Blekksprut, sammen med blekksprut og blekksprut, tilhører Coleoidea, den myke feste blæksprutten. Cephalopods som tilhører den andre underklassen, Nautiloidea, har skjell.
Phylum: Mollusca
Blekksprut er bløtdyr, en klassifisering som inkluderer gastropoder som snegler og snegler, muslinger som muslinger og østers, og flere andre forskjellige klasser. Bløtdyr utgjør mer enn 23 prosent av klassifiserte marine organismer, mer enn noen annen fylum, og finnes også på land og i ferskvann. Mange bløtdyr har ytre skall, men andre, inkludert blekkspruter, ikke.
Virvelløse dyr
Enda bredere er blekksprut virvelløse dyr. Denne klassifiseringen inkluderer alle dyrearter bortsett fra de som tilhører underfilen Vertebrata, som inkluderer fisk, pattedyr, reptiler, fugler og amfibier. Hvirvelløse dyr er preget av mangel på ryggrad.
Protostomer
Blekksprutter er protostomer. Denne klassifiseringen er i stor grad basert på embryonal utvikling. Alle bilateralt symmetriske dyr er delt inn i to grupper: protostomer og deuterostomer. Tidlig i utviklingen dannes en bulke eller depresjon kalt blastopore i embryoet. I deuterostomer, som inkluderer alle virveldyr, dannes denne bulken til slutt inn i anusen. I protostomer som blekkspruter dannes blastopore i munnen.