El Paso fylke ligger i Vest-Texas. Byen El Paso ligger på fylkets sørligste spiss. Det er her mange av fylkets forurensningsproblemer har sitt utspring. Byen El Paso deler en felles grense med Ciudad Juarez i Mexico. De to byene er delt av Rio Grande-elven. I tillegg til den delte grensen deler de også en vannforsyning og luftskur på grunn av innhegningen i en dal mellom to fjellkjeder.
El Paso deler et luftskur med den meksikanske byen Ciudad Juarez. Denne luftboden, kjent som Paso del Norte, sitter i et basseng som består av fjellene som omgir de to byene. Inne i luftboden er synligheten ofte dårlig og luftveisproblemer hyppige. Paso del Nortes luftproblemer stammer fra en rekke utslippskilder kombinert med uheldige meteorologiske forhold. El Paso oppfyller ikke amerikanske føderale luftkvalitetsstandarder og er derfor utpekt som et føderalt område uten oppnåelse. Det overstiger nivåene som anses som trygge for ozon, karbonmonoksid og PM-10. En indeks utviklet for å rangere byer i henhold til vektede estimater av eksponering for luftforurensende stoffer rangerte El Paso som landets sjette verste.
Mange giftige kjemikalier fra industrielle og landbruksmessige kilder finner veien inn i Rio Grande-elven. I 1995 var det mer enn 1400 industrianlegg i grenseområdet. Samme år ble det funnet 30 potensielt skadelige kjemikalier i elva som oversteg screeningnivået. Disse inkluderte arsen, kadmium, krom, kobber, bly, nikkel, selen, sink og kvikksølv. Fra 2002 ligger El Paso på de verste 60 prosent av byene når det gjelder de viktigste kjemiske utslippene og deres tilknyttede kreftrisiko, utviklingstoksiske stoffer og reproduksjonstoksiske stoffer.
Bly er den vanligste landforurensningen i El Paso, etterfulgt av kobber. El Paso har to anlegg som er ansvarlige for å slippe giftige kjemikalier ut i landet. Dette er US Army Air Defense Artillery Center og Phelps Dodge Copper Products Company.