En sentrifuge er et apparat som består av et rom som spinner på en sentral akse. Den spinnende bevegelsen får materialer til å skille seg basert på deres forskjellige gravitasjon. En sentrifugerotor er den roterende enheten til sentrifugen, som har faste hull boret i en vinkel. Testrør er plassert inne i disse hullene, og rotoren spinner for å hjelpe til med separasjonen av materialene. Det er tre typer sentrifugerotorer: svingbøtte, faste vinkler og vertikale rotorer.
En svingebøtterotor støtter vanligvis prøver som varierer i volum fra 36 ml til 2,2 ml. Swing-bøtter kan støtte to typer separasjoner: rate-zonal og isopycnic. Swing-bøtter er foretrukket for separasjonshastighetssoner, fordi avstanden mellom utsiden av menisken og utsiden av bunnen av røret er lang nok til at det kan skille seg.
Rotorer med fast vinkel brukes vanligvis til pelleteringsapplikasjoner til enten pelletspartikler fra en suspensjon og fjerne overflødig rusk, eller for å samle opp pelleten. Rotorhulrom varierer fra 0,2 ml til 1 ml. Det viktigste aspektet ved å bestemme seg for å bruke en rotor med fast vinkel er K-faktoren. K-faktoren indikerer hvor effektiv rotoren kan pelletere ved maksimal hastighet. Jo lavere K-faktor, jo høyere pelleteringseffektivitet.
Vertikale rotorer er høyt spesialiserte. De brukes vanligvis til å binde DNA i cesiumklorid. Vertikale rotorer har svært lave K-faktorer, noe som er nyttig hvis partikkelen bare må bevege seg en kort avstand til den pelleterer. Driftstiden på vertikale rotorer er kort.