De structuur van dubbelstrengs DNA is universeel in alle levende cellen, maar er zijn verschillen in de methoden voor het extraheren van genomisch DNA uit dierlijke en plantaardige cellen. Hoewel genomisch DNA in de celkern leeft, hangt de hoeveelheid en zuiverheid van het geëxtraheerde DNA af van het type en de grootte van de cel. Bepaalde cellen bevatten bijvoorbeeld meer DNA en onzuiverheden dan andere. Lees verder om meer te weten te komen over verschillen in DNA-extractie.
Algemene DNA-extractie
Als je plantaardige en dierlijke cellen behandelt met een zeepachtige substantie, worden de lipiden in de cel en kernmembranen afgebroken. Vervolgens zal het DNA-mengsel zich scheiden van de celmembranen en eiwitten. Vervolgens kun je alcohol gebruiken om het DNA in de oplossing neer te slaan. Afhankelijk van de hoeveelheid in het monster kan DNA met het blote oog zichtbaar zijn. Houd er echter rekening mee dat deze eenvoudige procedure niet noodzakelijkerwijs DNA van hoge zuiverheid produceert.
Plantaardige en dierlijke cellen
Plantencellen verschillen van dierlijke cellen vanwege hun stijve celwand en organellen zoals de chloroplast. Ze bevatten ook eiwitten en enzymen die een rol spelen bij de fotosynthese. Sommige plantencellen hebben polyploïdie, wat betekent dat ze meer dan één kopie van elk chromosoom per cel hebben. Bovendien produceren cellulaire processen die in planten voorkomen, zoals fotosynthese, een reeks secundaire metabolieten. Dierlijke cellen hebben geen celwand, maar hebben nog steeds chemicaliën zoals natriumdodecylsulfaat (SDS) nodig om het celmembraan te verstoren om genomisch DNA vrij te maken.
Plantaardige DNA-extractie
Genomisch DNA van planten is moeilijker te extraheren vanwege de celwand van de plant. Je kunt het verwijderen door te homogeniseren of door cellulase toe te voegen om de cellulose waaruit de celwand bestaat af te breken. Bovendien kunnen de metabolieten die aanwezig zijn in de plantencel interfereren met genomische DNA-extractie door het DNA-monster te besmetten tijdens het precipitatieproces.
Dierlijke DNA-extractie
Perifere bloedleukocyten zijn de belangrijkste bron van dierlijk genomisch DNA, maar het verzamelen van monsters is moeilijk omdat het bloed rechtstreeks van het dier moet komen. Bloed bevat een reeks verbindingen zoals eiwitten, lipiden, witte bloedcellen, rode bloedcellen, bloedplaatjes en plasma, die het DNA-monster kunnen besmetten. De primaire verontreiniging van dierlijk DNA dat uit bloedmonsters wordt geëxtraheerd, is echter heem, de niet-eiwitcomponent van hemoglobine.
De DNA-verschillen
De verschillen tussen plantaardig en dierlijk DNA liggen in de volgorde van basen in de helix. Verbindingen die in plantencellen worden gevonden, zijn afwezig in dierlijke cellen, en DNA-basesequenties weerspiegelen dit. Ook is het genomische planten-DNA vaak groter dan dierlijk DNA. Deze verschillen zijn ook van invloed op extractiemethoden, opbrengst en de zuiverheid van DNA.