Desoxyribonucleïnezuur, in de volksmond beter bekend als DNA, is een molecuul dat wordt aangetroffen in de overgrote meerderheid van levende organismen en virussen die op aarde worden aangetroffen. DNA draagt de genetische informatie, of de code, die alles maakt tot wat het is.
DNA verschilt tussen soorten en tussen individuen binnen een soort. Bij mensen bepaalt DNA bijvoorbeeld de kleur van menselijke ogen, huid, haar, lengte en elk ander kenmerk dat elke persoon uniek maakt.
DNA, genen en allelen
DNA is opgebouwd uit verschillende genen. Genen dragen de genetische informatie van elke ouder.
Elk gen wordt gevonden op een specifieke locus op een chromosoom. Een gen kan hebben meerdere variaties opgebouwd uit verschillende allelsequenties.
Allelen en fenotypen
allelen bepalen van zichtbare individuele kenmerken, genaamd fenotypes. Blauw, groen, bruin en hazelaar zijn bijvoorbeeld allemaal verschillende fenotypes voor het menselijk oog.
Als we kijken naar een van de vele genen voor oogkleur bij een groep mensen, zouden mensen met blauwe ogen een andere volgorde van allelen hebben dan die met bruine, hazelnootkleurige en groene ogen.
Definitie allelfrequentie Frequency
De allelfrequentie is het aantal individuen in een populatie dat een specifiek alleltype. Mensen gebruiken de allelfrequentieberekening om inzicht te krijgen in de snelheid waarmee een fenotype in een populatie voorkomt.
Deze informatie geeft inzicht in de genetische diversiteit in een populatie. Wanneer allelfrequenties in de loop van de tijd worden geregistreerd, kunnen veranderingen in genetische diversiteit worden waargenomen.
Bereken allelfrequentie
Om de allelfrequentie te berekenen, moet het totale aantal individuen in de populatie worden geteld. Tel vervolgens het aantal individuen dat elk het specifieke fenotype in kwestie heeft.
Maak een optelling van alle totalen. Om de allelfrequenties te vinden, deelt u het aantal keren dat een allel in een populatie wordt geteld door het totale aantal allelkopieën dat in dat gen wordt gevonden.
Voorbeeldberekeningen
Stel bijvoorbeeld dat er 100 individuen in een populatie zijn en twee soorten allelen, B voor blauwe ogen en G voor groene ogen. Elke persoon heeft twee kopieën van elk allel, dus vermenigvuldig twee met 100 om 200 allelkopieën in de populatie te krijgen.
In het echte leven zijn er veel genen die coderen voor de kleur van het menselijk oog, maar voor dit scenario zijn er slechts drie verschillende allelcombinaties in deze genenpool; BB, BG en GG. Tel vervolgens het aantal mensen in de populatie met elk alleltype.
Voorbeeld genotypische frequenties
In dit voorbeeld zijn er 50 mensen met BB, 23 mensen met BG en 27 mensen met GG. Om de genotypische frequenties te vinden, deelt u eenvoudig het aantal mensen met een specifiek fenotype door het totale aantal mensen.
In dit geval betekent 50 BB gedeeld door 100 mensen dat 50 procent van de bevolking het BB-genotype heeft. De genfrequentie voor BG zou 23 procent zijn en 27 procent van de mensen in de genenpool zou het GG-gentype hebben.
Voorbeeld van allelfrequenties
Terwijl genotypische frequenties kijken naar de expressie van de genen, kijken allelfrequenties naar het aantal keren dat een specifiek allel voorkomt in een populatie. Om de allelfrequentie van B in dit voorbeeld te vinden, vermenigvuldigt u 50 met twee, aangezien er twee B's zijn in het BB-genotype.
Voeg vervolgens de mensen met het BG-genotype toe, aangezien ze ook elk een B-allel hebben, wat een totaal van 123 B-allelen oplevert. Deel ten slotte 123 door 200 als elke persoon in de populatie draagt twee allelen, wat een allelfrequentie van 0,615 of 61,5 procent oplevert.
Doe vervolgens hetzelfde voor het G-allel. Door de 27 mensen met GG-allelen te vermenigvuldigen met twee en de 23 mensen die ook een G-allel hebben op te tellen en dit aantal, 77, te delen door 200, resulteert dit in 0,385 of 38,5 procent.
Controleer op fouten door ervoor te zorgen dat alle allelfrequenties optellen tot 1 of 100 procent. Hier is 61,5 opgeteld bij 38,5 gelijk aan 100.
Genotypische en allelfrequenties interpreteren
Deze berekeningen hebben informatie opgeleverd over hoeveel mensen blauwe fenotype-ogen hebben en hoeveel groene fenotype-ogen in deze populatie van 100 mensen. Uit de allelfrequenties blijkt duidelijk dat het B-allel dominanter is in een populatie.
Door dit onderzoek in toekomstige generaties voort te zetten, zal duidelijk worden of er in de loop van de tijd veranderingen optreden in de allelfrequenties en enig inzicht verschaffen in de evolutie van de bevolking.
