Hoe het iso-elektrische punt van peptiden te berekenen

Peptiden zijn korte polymeerfragmenten die zijn samengesteld uit aminozuren. Elk peptide heeft een bepaalde aminozuursequentie die wordt aangegeven met een code van drie of één letter; het aminozuur alanine wordt bijvoorbeeld afgekort als "Ala" of "A". De lading van de peptiden in de oplossing hangt af van de zuurgraad van de oplossing. Het iso-elektrische punt (pI) verwijst naar de zuurgraad van de oplossing waarbij het peptidemolecuul de netto lading van nul heeft. De oplosbaarheid van het peptide is minimaal op het iso-elektrische punt. Gebruik beschikbare webservers om de pI-waarde voor een peptide-aminozuursequentie te berekenen.

Schrijf de peptidesequentie met behulp van de eenletterige code. Als een peptide bijvoorbeeld een aminozuursequentie Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanine-Serin-Glumatic acid-Leucine-Proline) heeft, dan is de reeks van één letter "ASELP". Raadpleeg indien nodig de conversietabel van drie letters naar één letter in table Middelen.

Gebruik bijvoorbeeld een webbrowser, Internet Explorer of Firefox om naar een server te navigeren die het peptide iso-elektrisch punt (pI) berekent; zie bronnen.

Lees de waarde van het iso-elektrisch punt (pI) in de regel "Theoretische pI/Mw." In ons voorbeeld is de pI 4,00. Merk op dat de server ook het molecuulgewicht (Mw) van het peptide berekent.

Over de auteur

Oxana Fox is een freelance schrijver die gespecialiseerd is in medicijnen en behandelingen, computersoftware en -hardware, digitale fotografie en financiële diensten. Ze studeerde in 1988 af aan het Moscow Medical College met een formele opleiding in kindergeneeskunde.

Fotocredits

Comstock-afbeeldingen / Comstock / Getty-afbeeldingen

  • Delen
instagram viewer