Hoewel het lijkt alsof de diepe, donkere omgevingen van grotten nooit het plantenleven zouden kunnen ondersteunen, gedijen bepaalde soorten flora in die omgeving. Grotten zijn vaak vochtig en hebben een constante temperatuur, een ecologie die ideaal is voor planten zoals schimmels, mossen en algen. Planten kunnen zelfs groeien in de elektrische lampen die mensen meenemen om grotten te verkennen.
Grotzones
Grotten zijn opgedeeld in drie zones: ingang, schemering en donker. De entreezone heeft nog steeds veel licht om vele soorten planten zoals bomen en grassen te ondersteunen. In de schemerzone kan enig licht doordringen, maar dit is niet voldoende om de meeste soorten planten te ondersteunen. Sommige planten kunnen echter in deze zone overleven, bijvoorbeeld mossen en varens. De donkere zone heeft geen natuurlijk licht en kan alleen de meest winterharde planten ondersteunen zoals schimmels en algen.
Planten in de schemerzone
Naarmate de hoeveelheid licht afneemt, neemt ook de omvang en complexiteit van het plantenleven af. Dus terwijl er in de ingangszone bloeiende planten kunnen groeien, wordt de schemerzone meestal gemarkeerd door mossen en varens. Planten die in dit deel van de grot leven, hebben aanpassingen ontwikkeld waardoor ze in zulke omstandigheden met weinig licht kunnen leven. Een van die aanpassingen is dat hun chloroplasten, de zonlichtvangende moleculen in een plant, zich allemaal verzamelen aan de rand van de cel die zich het dichtst bij de lichtbron bevindt.
Planten in de donkere zone
Ook al is er bijna geen licht in de donkere zone, toch kunnen planten groeien. Vooral schimmels zijn bedreven in het leven op deze donkere plaatsen. Schimmels gedijen vooral goed omdat grotten vol zitten met voedselrijke vleermuis-guano, een perfecte bodem voor paddenstoelen. Algen kunnen ook in de donkerste delen van grotten leven. In plaats van fotosynthese te gebruiken, kunnen deze algen een ander metabolisch pad gebruiken om hun energie te produceren.
Lampenflora
Planten kunnen ook groeien in grotten die zijn uitgerust met elektrische verlichting. Deze planten, bekend als lampenflora, hebben de neiging minder levendig van kleur te zijn en enigszins misvormd. Typisch, lampenflora zijn mossen, varens en algen. In grotten die constant worden verlicht door lampen, kunnen deze invasieve planten problemen veroorzaken voor de natuurlijke structuur van de grot of voor eventuele prehistorische muurkunst. Vanwege hun schadelijke aard worden lampenflora meestal bestreden door middel van fysieke, chemische en biologische methoden.