Hoe Audpc te berekenen

De Area Under the Disease Progress Curve (AUDPC) is een kwantitatieve maat voor de ziekte-intensiteit in de tijd. Het wordt gebruikt in de plantenpathologie om niveaus van resistentie tegen ziekten tussen plantenrassen aan te geven en te vergelijken. De trapeziummethode is de meest gebruikelijke manier om AUDPC te berekenen. Het wordt uitgevoerd door een formule te gebruiken die in 1990 door Campbell en Madden is bedacht of door een grafiek van het infectiepercentage tegen de tijd uit te zetten en de trapezoïden tussen tijdsintervallen op te tellen.

Onderzoeksregels en richtlijnen die van toepassing zijn op het meten van de specifieke ziekte en het gewas dat je onderzoekt. De benodigde grootte van het plantenmonster verschilt per gewas en ziekte. Voor het bestuderen van Phytophthora in knollen is bijvoorbeeld een monster van minimaal 40 planten nodig.

Let goed op tekenen van de ziekte. Onderzoek wanneer er tekenen optreden, zodat u voorbereid bent. Tekenen van Phytophthora verschijnen bijvoorbeeld ongeveer 30 tot 40 dagen na het planten en 10 dagen na de laatste toepassing van fungicide.

Noteer het percentage geïnfecteerd bladoppervlak met regelmatige tussenpozen. Onderzoekers lezen elke zeven dagen voor Phytophthora als de ziekte sneller vordert dan verwacht. Metingen worden elke 14 dagen genomen wanneer de ziekteprogressie langzamer is.

Stop met het opnemen van infectiemetingen wanneer het infectiepercentage niet meer toeneemt en het ziekteprogressieniveau stopt.

Vermenigvuldig de gemiddelde of middenwaarde met het tijdsinterval, dat is het aantal dagen vanaf de eerste meting tot de tweede meting. Als u bijvoorbeeld de eerste meting op dag 20 en de tweede meting op dag 27 hebt gedaan, is het aantal dagen of tijdsinterval zeven dagen.

Herhaal stap één tot en met vier voor de tweede en derde infectiemetingen die u hebt gedaan. Hun resultaat is de oppervlakte van een tweede trapezium. Herhaal stap één tot en met vier totdat u de trapeziumvormige gebieden voor alle metingen hebt berekend.

Voeg alle trapezoïden toe om de AUDPC te vinden. Lagere AUDPC's vertegenwoordigen een langzamere ziekteprogressie en een grotere weerstand tegen de ziekte. Hogere AUDPC's vertegenwoordigen een snellere ziekteprogressie en een hogere gevoeligheid voor de ziekte.

  • Delen
instagram viewer