Meža apsaimniekotāju un meža īpašnieku, kas apsaimnieko savu zemi pēc mežu apsaimniekotāju ieteikumiem, rīcībā ir plašas apsaimniekošanas metodes. Katra metode ietver iespēju un darbību kopumu, kas paredzēti konkrēta mērķu kopuma sasniegšanai.
Šīs darbības var būt no visa nedarīšanas līdz visu vai gandrīz visu koku izciršanai. Lokšņu koku izciršana ir metode, kas ir vairāk vai mazāk pusceļā starp šīm divām galējībām. Tas ietver dažu koku nozāģēšanu, vienlaikus atstājot citus, lai palīdzētu pasargāt jaunu augšanu. Šai praksei un patversmes koka izstrādājumiem ir daudz iespējamo priekšrocību un trūkumu.
Koku bojājumi
Jebkurā laikā, kad mežizstrādātāji dodas mežā, lai noņemtu pat vienu koku patvēruma koksnes izstrādājumiem, tas, iespējams, nodarīs vismaz dažus papildu zaudējumus pārējiem kokiem. Kā vairāk mežizstrādes darbība turpinās un tiek ievesta vairāk mašīnu, jo lielāka būs ietekme.
Koku bojājumus var izraisīt patversmes koku mežizstrādes aprīkojums - piemēram, sānslīdes, kas baļķus izvelk no meža -, kasot kokus, savukārt krītoši koki var arī salauzt ekstremitātes vai saberzt atlikušos kokus. Šāda veida bojājumi var pasliktināt šo atlikušo koku vērtību nākamajās ražās.
Augsnes blīvēšana
Augsnei dabiskā veidā ir noteikts augsnes daļiņu un gaisa telpu līdzsvars noteiktā tilpumā. Šīs atstarpes starp daļiņām un starp tām nodrošina skābekļa un ūdens iekļūšanas augsnē ceļus. Smagas pajumtes mežizstrādes mašīnas, kas darbojas mežā, var saspiest augsni, izraisot daļiņu saspiešanu un samazinot atstarpes starp tām.
Tas savukārt traucē gaisa un ūdens pārvietošanos augsnē, atņemot koku saknēm un citu augu saknēm skābekli un ūdeni. Tāpat kā citas ietekmes gadījumā, augsnes sablīvēšanās var būt viegla, mērena vai smaga.
Koku zaudēšana
Atverot meža stendu pret elementiem, veicot nocirsto koku koku, atlikušie koki var tikt pakļauti stresam, ko viņiem citādi nebūtu. Vējš ir viens svarīgs faktors, jo vērtīgi koki, kas paliek pēc sākotnējās patversmes koku izciršanas, ir neaizsargātāki pret izpūšanu tāpēc, ka vienkārši nav aizsargu, ko nodrošināja iepriekš neskarts statīvs, lai izgatavotu patvēruma koku produktiem.
Augsnes erozija
Papildus augsnes sablīvēšanai, darbojoties pajumti apstrādājošām mežizstrādes mašīnām mežā un baļķu vilkšanai uz zemes (mežizstrādes nozarē to sauc par "sānslīdi"), var atklāt augsni erozijas spēkiem lietus un tekoša ūdens. Bez daudzu sakņu, kas stabilizēja augsni pirms traucējumiem, augsni saistošā ietekme, lietus un no tā izrietošā notece var novest augsni. Tas pasliktina vietas spēju atbalstīt koku un citu augu augšanu.
Citas nelabvēlīgas augsnes erozijas sekas ir nosēdumi, kas ir erodētas augsnes nogulsnēšanās ūdenstecēs. Šī pārvietotā augsne var aizrīties ar ūdens ceļiem un dažreiz gandrīz burtiski aizrādīt ūdens organismus, traucējot žaunu darbību.
Invazīvas sugas
Daudzās jomās svešzemju augu sugas ir kļuvušas problemātiskas. Daži no tiem var būt ļoti invazīvi, taču bieži vien viņi patiešām nesaņem atbalstu, kamēr nav traucējumu. Mežizstrādes darbība, piemēram, patversmes koku izciršana, var nodrošināt šo traucējumu, paverot iespēju eksotiskiem augiem ieņemt vietu. Tas, iespējams, notiek uz vēlamo koku vai citas veģetācijas jaunās paaudzes rēķina, ko, iespējams, bija iecerējuši mežsaimnieki, kas apsaimnieko šo vietu.