Misisipi upē dzīvo dažādi ūdens augi un dzīvnieki sarežģītā, savstarpēji saistītā ekosistēmā. Ūdens augi nodrošina pārtiku un pajumti daudzām dažādām upes sugām, un tie var būt tikpat mazi kā vienšūnu aļģes. Misisipi upē ir virkne dzīvnieku, sākot no bezmugurkaulniekiem līdz zivīm, vardēm un citiem.
Aļģes
Saskaņā ar Aiovas Dabas resursu departamenta datiem, Misisipi spēlē divus galvenos aļģu veidus: zaļo un zili zaļo. Zaļās aļģes ir jebkuras veselīgas ekosistēmas galvenā bioloģiskā sastāvdaļa; tie rada lielas kolonijas, kas ūdenim var piešķirt zaļganu nokrāsu. Zilaļģes ir mazāk vēlamas un tiek uzskatītas par traucējošām aļģēm. Tie ir saistīti ar saspringtām ekosistēmām un var izraisīt nepatīkamas garšas zivīs vai nogalināt veselas populācijas.
Duckweed
Šim parastajam brīvi peldošajam augam ir viena sīka lapa un saknes, kas karājas ūdenī, lai iesūktu barības vielas. Kā norāda nosaukums, pīļaugi ir svarīgs pārtikas avots daudziem ūdensputniem.
Ūdensrozes
Baltās ūdensrozes ir izplatīta vieta Misisipi upē, un tās veido lielas, peldošas lapas ar ādainu tekstūru. Viņi aug lielu baltu ziedu virs lapām un sakņojas dubļos zemāk.
Vēži
Šie vēžveidīgie, kurus sauc arī par vēžiem vai rāpuļiem, atgādina mazos omārus. Tās galvenokārt ir padeves barotavas, un tās patērē citu dzīvnieku, gaļas un mazu dzīvnieku izplūšanu. Misisipi upē dzīvo gan vietējie, gan invazīvie vēži.
Sams
Lamanša sams ir izplatīts skats Misisipi upē. Tie ir visplašākais sams. Šīs zivis var izaugt līdz pārsteidzošiem izmēriem un galvenokārt turēties pie upes dibena. Viņi ir ievērojami ar savu tendenci sist daudz dažādu ēsmu, taču tos vajadzētu ēst reti PCB (polihlorētā bifenila) piesārņojuma briesmu dēļ.
Leoparda varde
Šīs plankumainās vardes sauc arī par pļavas vardēm. Viņi dzīvo Misisipi upē un tās apkārtnē. Viņi bieži kalpo kā vides indikatoru sugas, jo ir uzņēmīgi pret piesārņotājiem un piesārņotājiem. Viņi lielāko daļu laika pavada gar strautu un citu ūdenstilpju malām un ēd galvenokārt kukaiņus, posmkājus un citus bezmugurkaulniekus.