Abiotiskā iezīme ir ekosistēmas nedzīva sastāvdaļa, kas ietekmē dzīvo lietu uzplaukumu. Ūdens biomas ietver okeānu, ezerus, upes, straumes un dīķus. Jebkura ūdenstilpe, kas satur dzīvību, ir ūdens bioms. Ūdens biomās ir daudz abiotisko īpašību, taču tās ir īpaši atkarīgas no piecām no šīm pazīmēm.
Saules gaisma
Saules gaisma ir vitāli svarīga fotosintēzei, kas veido pamatu lielākajai daļai pārtikas ķēžu ūdens biomos. Seklā ūdenī pieejamais saules gaismas daudzums lielā mērā ir atkarīgs no mainīgiem faktoriem, piemēram, sezonas, mākoņu segas un vietējās ģeogrāfijas. Okeāna un dažu ezeru dziļajā ūdenī saules gaisma tomēr iekļūst tikai daļiņā ceļa līdz dzelmei, atstājot milzīgus ūdens līcīšus pilnīgā tumsā. Okeāna lielākajā daļā saules gaismas vispār nav. Dzīve šajos dziļumos lielā mērā ir atkarīga no nogrimšanas lūžņiem no seklākām ekosistēmām.
Temperatūra
Nelielās ūdenstilpēs temperatūra var ievērojami svārstīties starp dienu un nakti, kā arī pēc sezonas. Organismiem jābūt gataviem tikt galā ar šīm svārstībām vai izmirt. Lielos ezeros un dziļajos okeānos temperatūra ir atkarīga no dziļuma. Tā kā saules gaisma ar dziļumu mazinās, ūdens kļūst vēsāks un temperatūra mazāk atkarīga no virsmas apstākļiem. Dziļi okeānā temperatūra nokrīt līdz gandrīz sasalšanai un paliek neticami stabila. Izņēmums ir niecīgas pārkarsēta ūdens "salas", ko nodrošina vulkāniskās atveres okeāna dibenā, kas attīsta savas augsti specializētās ekosistēmas.
Ķīmiskais sastāvs
Divas vissvarīgākās ūdenī izšķīdušās ķīmiskās vielas ir skābeklis un oglekļa dioksīds. Skābeklis ir vajadzīgs, lai uzturētu dzīvniekus un dažas aļģu formas, savukārt oglekļa dioksīds ir vajadzīgs, lai uzturētu augu dzīvi. Ja tiek iznīcināts līdzsvars starp šīm divām ķīmiskajām vielām, rezultāts var būt masveida augu vai dzīvnieku dzīves pārtraukšana. Ūdens ķīmisko sastāvu ietekmē arī vietējie augsnes apstākļi un cilvēku darbības notece. Neliels dažu ķīmisko vielu līmeņa paaugstināšanās var būt ļoti kaitīga ūdens organismiem.
Reljefs
Lai izmantotu zemūdens reljefu, ir attīstījušās ļoti dažādas ekosistēmas. Lēna upe ar dubļainu dibenu saturēs pavisam citu zivju populāciju nekā straume, kas plūst ātri un skaidri pāri akmeņiem. Okeānā ir dažādas populācijas, kas atkarīgas no koraļļu rifiem, smilšainiem krastiem, akmeņainu salu stiprinājumiem vai atklātā okeāna plašumiem. Bieži vien suga dzīves ciklā būs atkarīga no vairāk nekā viena reljefa, lai gan daži ir speciālisti, kuri nespēj izdzīvot ārpus šaura reljefa diapazona.
Ūdens traucējumi
Ūdens traucējumi var izpausties kā viļņi, straumes vai upju kustība. Traucējumu daudzums, ko izjūt ūdenstilpe, nosaka skābekļa un oglekļa dioksīda daudzumu, kas izšķīdis no ūdens atmosfēra, temperatūras noslāņošanās no virsmas līdz lielākam dziļumam un ķīmisko vielu ietekme, kas atrodas ūdens. Stāvošam ezeram būs šaurāks un stingrāk definēts temperatūras slāņu kopums nekā viļņu pārspētam okeānam, savukārt dzīves prasības strauji plūstošā upē atšķiras no abām.