Kaip apskaičiuoti peptidų izoelektrinį tašką

Peptidai yra trumpi polimerų fragmentai, sudaryti iš aminorūgščių. Kiekvienas peptidas turi tam tikrą aminorūgščių seką, žymimą trijų raidžių arba vienos raidės kodu; pavyzdžiui, aminorūgštis alaninas sutrumpintai reiškia „Ala“ arba „A.“ Peptidų kiekis tirpale priklauso nuo tirpalo rūgštingumo. Izoelektrinis taškas (pI) reiškia tirpalo rūgštingumo vertę, kuriai esant peptido molekulės grynasis krūvis yra lygus nuliui. Peptido tirpumas izoelektriniame taške yra minimalus. Norėdami apskaičiuoti peptido aminorūgščių sekos pI vertę, naudokite turimus interneto serverius.

Parašykite peptidų seką naudodami vienos raidės kodą. Pavyzdžiui, jei peptidas turi aminorūgščių seką Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alaninas - Serinas - Glimatino rūgštis - Leucinas - Prolinas), tada vienos raidės seka yra „ASELP“. Jei reikia, perskaitykite trijų raidžių į vieną raidžių perskaičiavimo lentelę, pateiktą Ištekliai.

Pavyzdžiui, naudokite bet kurią interneto naršyklę, „Internet Explorer“ ar „Firefox“, norėdami pereiti į serverį, kuris apskaičiuoja peptido izoelektrinį tašką (pI); žr. Ištekliai.

instagram story viewer

Perskaitykite isoelektrinio taško (pI) vertę, pateiktą eilutėje "Teorinė pI / Mw". Mūsų pavyzdyje pI yra 4,00. Atkreipkite dėmesį, kad serveris taip pat apskaičiuoja peptido molekulinę masę (Mw).

apie autorių

Oxana Fox yra laisvai samdoma rašytoja, kurios specializacija yra medicina ir gydymas, kompiuterių programinė ir techninė įranga, skaitmeninė fotografija ir finansinės paslaugos. Ji baigė Maskvos medicinos koledžą 1988 m., Gavusi oficialius pediatrų mokymus.

Nuotraukų kreditai

„Comstock Images“ / „Comstock“ / „Getty Images“

Teachs.ru
  • Dalintis
instagram viewer