Spygliuočių medžiai turi dviejų tipų kūgius: žiedadulkių kūgį ir sėklinį kūgį. Kai kurie spygliuočiai turi abu kūgių tipus ant to paties medžio, todėl medis gali pats apdulkinti. Kryžminis apdulkinimas įvyksta, kai iš vieno medžio išauga tik sėklų spurgai, todėl jis turi būti apvaisintas žiedadulkėmis, nutekančiomis į sėklų kūgius iš žiedadulkių kūgių, esančių ant kitų netoliese esančių medžių.
Žiedadulkių kūgiai yra mažesni ir platesni už sėklų spurgus. Žiedadulkių kūgeliai linkę į vietą ir žūsta, kai žiedadulkės spurgose išleidžiamos apvaisinti sėklų spurgus. Ramybės stadijoje spygliuočių pumpuras gali būti patinas, patelė arba vegetatyvinis. Šiame etape atskirti pumpurų tipus galima tik išskaidant. Viena nuoroda, kuri gali padėti nustatyti žiedadulkių kūgį, yra jo vieta. Sėklų kūgeliai linkę vystytis aukščiau medyje, kad padėtų pasklisti, kai sėklos apdulkinamos.
Sėklų kūgiai dažniausiai naudojami medžio tipui nustatyti, nes jie ilgesnį laiką išlieka ant medžio ar po juo. Ploni sėklų kūgio pumpurai išbrinksta keturias – šešias savaites, kol pradeda ryškėti raudonos arba žalios spalvos ovuliferinės žvynai. Svarstyklės linkusios sulankstyti tiesiai nuo kūgio pagrindo, o paskui nusileidusios, priėmusios žiedadulkes iš žiedadulkių kūgių, kad inicijuotų sėklos vystymąsi ir signalizuotų kūgio brandą.
Kai kuriuose spygliuočiuose nėra nei žiedadulkių, nei sėklų spurgų. Vietoj to, medis duoda vaisių, kuris dalinai uždengia sėklas. Kanados kukmedis yra arilą gaminančio spygliuočio, kuriame yra mėsinga danga, kurioje yra medžio sėklos, pavyzdys. Siekiant užkirsti kelią sėklų pertekliui dėl gyvūnų ir paukščių plėšrūnų, kurie gali norėti maitintis kukmedžio vaisius, šis medis prisitaikė taip, kad jo vaisiai būtų nuodingi ir liktų sėklos netrikdomas.
Spygliuočiai, turintys kūgį, arba pinophyta, priskiriami gimnospermoms (plikos sėklos), nes jų kiaušialąstės ir sėklos nėra uždarytos kiaušidėse arba yra apsauginėse vaisių dangose. Jei spygliuočio žiedadulkės ir sėklos spurgos yra ant to paties medžio, jis toliau klasifikuojamas kaip diploidinis sporofitas. Susidarius sėkloms po apdulkinimo, kūgio žvyneliai atsiveria, kad išleistų sėklas vandens, vėjo ir žmogaus bei gyvūnų judėjimo pasklaidai.