Vanduo, naudojamas namuose, versle ir pramonėje, dažnai apdorojamas cheminiu būdu, siekiant pašalinti kenksmingas medžiagas ir bakterijas. Kai vanduo bus chemiškai apdorotas, jį galima saugiai perdirbti atgal į vandens šaltinį. Vandeniui valyti gali būti naudojamos kelios skirtingos cheminės medžiagos, tokios kaip chloras, kalkės ir vandenilio peroksidas. Kiekvienas metodas siūlo skirtingus vandens valymo privalumus ir trūkumus.
Chloras
Remiantis Vandens kokybės ir sveikatos tarybos duomenimis, prieš pradedant naudoti chloruotą geriamąjį vandenį amžiuje vandens plintančios ligos, tokios kaip cholera, vidurių šiltinė, dizenterija ir hepatitas, pareikalavo tūkstančių JAV gyvybių metus. Šiandien chloravimas vis dar yra labiausiai paplitęs viešojo geriamojo vandens ir baseinų dezinfekavimo būdas. Chlorinimas ne tik padeda užkirsti kelią tokioms infekcijoms kaip E. coli, jis taip pat naikina bakterijas, dumblius ir pelėsius, kurie gali augti ant vandens laikymo sistemų sienelių, ir pašalina nemalonų skonį ir kvapą iš geriamojo vandens. Nors chlorinimas veiksmingai išvalo geriamąjį vandenį, be kompetencijos ir patirties gali būti sunku jį tvarkyti. Dušui, plovimui ir maudynėms naudojamo vandens chlorinimas gali išsausinti odą ir plaukus, gali dirginti akis, taip pat gali išblukti audiniai.
Kalkės
Kietame vandenyje yra daug ištirpusių mineralų, kurie gali susidaryti vandens vamzdžiuose ir vidinėse sistemose, kad sukeltų kliūčių ir nuolatinių pažeidimų. Vandens minkštikliai, pagaminti iš hidratuotų kalkių, gali pagerinti vandens kokybę, kad pagerėtų kietasis vanduo ir taip pat sumažėtų toksiško arseno kiekis geriamajame vandenyje. Kalkės taip pat keičia vandens pH ir siekia sunaikinti aplinką, reikalingą bakterijų ir virusų augimui. Kai kuriais atvejais, kalkėms suminkštėjus, pH lygis tampa per didelis. Kai į chloruotą vandenį įpilama kalkių, susidaręs hipochloritas yra dezinfekavimo priemonė, prastesnė už kitų laisvo chloro likučius.
Vandenilio peroksidas
Vandenilio peroksidas yra balinimo priemonė, kuri gali būti naudojama balinant dantis, šviesinant plaukus, balinant audinius ir tekstilę. Jis taip pat gali būti naudojamas vandeniui dezinfekuoti pašalinant teršalus ir slopinant bakterinių veiksnių augimą. Vandenilio peroksidas paprastai laikomas saugiu, jis negamina likučių ar dujų ir gali būti naudojamas chloro likučiams, likusiems po chlorinimo, pašalinti. Medžiagą reikia transportuoti ir naudoti atsargiai, nes sąlytis su vandenilio peroksidu gali dirginti akis, odą, plaučius ir gleivinę. Be to, Lenntechas pažymi, kad Amerikos tarptautinės vėžio tyrimų agentūros atlikti tyrimai rodo, kad didelis vandenilio peroksido poveikis gali būti kancerogeninis gyvūnams.