Egzistuoja daug įvairių ekosistemų tipų. Vandens ekosistemos sudaro didelę pasaulio ekosistemų dalį ir gali būti priskiriamos gėlavandenėms arba jūrų ekosistemoms. Bet kokio tipo ekosistemos gyventojai bus prisitaikę prie išlikimo esant tam tikroms tos ekosistemos sąlygoms.
Ekosistema - tai bendruomenė, kurią jungia sudėtinga tam tikros srities biotinių ir abiotinių veiksnių sąveika. Biotiniai ekosistemos veiksniai yra gyvos dalys, tokios kaip augalai, gyvūnai, bakterijos ir grybai. Abiotiniai veiksniai apima dirvožemį, vandenį ir kitus negyvus daiktus, esančius aplinkoje. Ekosistema gali būti tokia didelė kaip dykuma arba maža kaip potvynio baseinas. Gyvų būtybių bus tik tiek, kiek jas gali palaikyti aprūpinimas maistu. Tokia sąveika kaip plėšrūno ir grobio bei maisto tinklo ryšiai lemia ekosistemos populiaciją. Kiekvienas gyvis turi atlikti savo vaidmenį, kuris prisideda prie bendros ekosistemos sėkmės ir išlikimo.
Jūrų terminas reiškia ekosistemą, susijusią su vandenynais. Aplinkos apsaugos agentūros (EPA) duomenimis, jūrų ekosistemos sudaro maždaug 70 procentų pasaulio ekosistemų. Jūrų ekosistemos yra unikalios dėl vandenyje suspenduotų tirpių junginių, ypač druskos. Tokie maži kaip mikroskopinis planktonas ir dideli banginiai organizmai gyvena įvairių tipų jūrų ekosistemose. Jūrų ekosistemoms priklauso vandenynai, žiotys ir druskos pelkės, koraliniai rifai, mangrovių miškai, lagūnos, rudadumblių jūros žolių lysvės ir potvynio potvynio zona, besitęsianti ant paplūdimių.
Yra daugybė gėlavandenių ekosistemų tipų. Upės, ežerai, tvenkiniai ir upeliai yra labiausiai paplitę gėlo vandens šaltiniai. Rezervuarai, pelkės ir požeminio vandens šaltiniai taip pat laikomi gėlo vandens ekosistemomis. Gėlavandenių ekosistemų vandenyje nėra tokių pat ištirpusių medžiagų kaip jūrų ekosistemose, todėl jose gyvenantys gyvūnai ir augalai neišgyventų jūrų ekosistemoje. Kadangi gėlame vandenyje nėra druskos, jis yra labiau linkęs užšalti ir atitirpti. Gėlo vandens augalai ir gyvūnai prisitaikė, kad išgyventų šį procesą. Jie taip pat turi kvėpavimo struktūras, pritaikytas specialiai gėlam vandeniui, ir turi išsivysčiusį reprodukcinį ir maitinimo elgesį, leidžiantį sėkmingai išgyventi savo aplinkoje.