ゲル電気泳動は、実験室で分離するために使用される方法です DNA (デオキシリボ核酸)。 RNAとタンパク質の分離にも使用できます。
ゲル電気泳動の結果を読み取ることで、研究者はサンプル中のストランドのサイズを決定できます。 プロセスがどのように機能するかを理解するには、最初にゲル電気泳動の定義を学ぶ必要があります。
ゲル電気泳動の定義
ゲル電気泳動は、 分子生物学 DNA、RNA、タンパク質のサイズと電荷を決定します。 あなたは、より大きなDNA鎖からの酵素によって消化されたDNAの断片を使用することから始めます。
結果としてゲル電気泳動バンド強度を使用すると、フラグメントのサイズを把握できます。 その後、 DNAフィンガープリント.
単語の「電気」部分が明らかにするように、 ゲル電気泳動の定義 電界の使用を伴います。 電極を覆う緩衝液、ゲルが内部に浮遊するためのウェル、および電極自体を含む特別な機械が使用されます。
ゲル電気泳動におけるゲル
ゲル電気泳動 通常、アガロースと呼ばれる海藻から精製されたバージョンの寒天で作られたスラブに形成されたゲルを使用する必要があります。
アガロースゲル さまざまなサイズの荷電分子がさまざまな速度で移動できる多孔質マトリックスを作成します。 臭化エチジウム(EtBr)と呼ばれる化学物質をゲル溶液に加えてから、型に流し込みます。
分離するDNAまたはタンパク質分子が非常に小さい場合は、 ポリアクリルアミドゲル アガロースの代わりに。 ポリアクリルアミドは神経毒性があるため、使用する場合は注意が必要です。
専用のコームをアガロースゲル型に入れ、固まったら丁寧に取り出します。 これは、DNAフラグメントまたは他の分子サンプルが配置される場所であり、最初に特別なローディング色素と混合されます。 ザ・ ローディング染料 DNAの動きを追跡するだけです。他の方法では見えないからです。
と呼ばれるものを含む井戸もあります DNAラダー またはマーカー。 これは、研究対象のDNAサンプルとサイズを比較するための、既知のバンドサイズを持つ高品質のテンプレートとして機能します。 電界が印加されると、これらの負に帯電した分子はゲルを通って正の端に向かって移動します。
ゲル電気泳動の結果
分子がゲルの終わりまで移動したら、それは読書の時間です ゲル電気泳動の結果. ゲル中のEtBr色素はDNAに容易に結合するため、その使用により、UV光の下でDNAのバンドが蛍光を発するのを見ることができます。
臭化エチジウムに触れないように細心の注意を払う必要があります。DNAとの親和性は、臭化エチジウムをほどくことができることも意味するからです。 したがって、変異原と見なされます。 価格は高くなりますが、より新しく、より安全な染料が利用可能になりました。
UV光は、DNAまたは他の分子サンプルのゲル電気泳動バンド強度を明らかにします。 ゲル上のバンドの位置は、のサイズを明らかにします DNAフラグメント. ザ・ ゲル電気泳動バンド強度 分子の濃度を明らかにします。
これで、サンプル内のDNAのバンドをDNAラダーサンプルと比較できます。 ラダーの既知のバンドサイズは、研究しているDNAの相対的なサイズを決定するのに役立ちます。
高品質のゲル電気泳動の重要性
ゲル電気泳動はで使用されています DNAフィンガープリントとフォレンジック. これは、研究者が多くの種のゲノムに関する情報を決定するのに役立ちました。 これらの重要な分野では、高品質のゲル電気泳動の結果を使用することが不可欠です。
したがって、高品質の成分を使用し、ゲルの製造には細心の注意を払うことが重要です。 DNAサンプルがRNAやタンパク質で汚染されるのを防ぐことが不可欠です。
必ずきれいなバッファーを使用し、ゲルを注意深く注ぎ、コームウェルが均一に形成されるようにし、すべての試薬を適切な温度に保ちます。 ゲル電気泳動 バンド強度は、バックグラウンドに他のDNAの痕跡がなく、ゲルを汚染するRNAまたはタンパク質の汚れがない、活気に満ちたクリーンなものでなければなりません。