ペプチドの等電点を計算する方法

ペプチドは、アミノ酸から構成される短いポリマーフラグメントです。 各ペプチドには、3文字または1文字のコードで示される特定のアミノ酸配列があります。 たとえば、アミノ酸アラニンは「Ala」または「A」と省略されます。 溶液中のペプチドの電荷は、溶液の酸性度に依存します。 等電点(pI)は、ペプチド分子の正味電荷がゼロになる溶液の酸性度の値を指します。 ペプチドの溶解度は等電点で最小です。 利用可能なWebサーバーを使用して、ペプチドアミノ酸配列のpI値を計算します。

1文字のコードを使用してペプチド配列を記述します。 たとえば、ペプチドのアミノ酸配列がAla-Ser-Glu-Leu-Pro(アラニン-セリン-グルマチン酸-ロイシン-プロリン)の場合、 その場合、1文字のシーケンスは「ASELP」です。 必要に応じて、に記載されている3文字から1文字への変換表を参照してください。 リソース。

たとえば、任意のWebブラウザ(Internet ExplorerまたはFirefox)を使用して、ペプチド等電点(pI)を計算するサーバーに移動します。 リソースを参照してください。

「理論上のpI / Mw」の行に示されている等電点(pI)値を読み取ります。 この例では、pIは4.00です。 サーバーはペプチドの分子量(Mw)も計算することに注意してください。

著者について

Oxana Foxは、医学と治療、コンピューターソフトウェアとハ​​ードウェア、デジタル写真と金融サービスを専門とするフリーランスのライターです。 彼女は1988年にモスクワ医科大学を小児科の正式な訓練を受けて卒業しました。

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コムストック画像/コムストック/ゲッティイメージズ

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