クロマトグラフィー技術は、未知のサンプルから化合物を分離するために科学研究所で実行されます。 サンプルは溶媒に溶解され、カラムを通過します。カラムでは、カラムの材料に対する化合物の引力によってサンプルが分離されます。 カラム材料へのこの極性および非極性の引力は、化合物を時間の経過とともに分離させるアクティブな力です。 現在使用されている2種類のクロマトグラフィーは、ガスクロマトグラフィー（GC）と高速液体クロマトグラフィー（HPLC）です。
ガスクロマトグラフィーはサンプルを気化し、ヘリウムなどの不活性ガスによってシステムに沿って運ばれます。 水素を使用すると、分離と効率が向上しますが、多くのラボでは、可燃性のためにこのガスの使用を禁止しています。 液体クロマトグラフィーを使用する場合、サンプルは液体状態のままであり、水、メタノール、アセトニトリルなどのさまざまな溶媒によって高圧下でカラムに押し出されます。 各溶媒の濃度が異なると、各化合物のクロマトグラフィーに異なる影響を及ぼします。 サンプルを液体状態のままにしておくと、化合物の安定性が向上します。
ガスクロマトグラフィーカラムの内径は非常に小さく、長さは10〜45メートルの範囲です。 これらのシリカベースのカラムは、円形の金属フレームに沿ってコイル状に巻かれ、華氏250度の温度に加熱されます。 液体クロマトグラフィーカラムもシリカベースですが、大量の内圧に耐えるために厚い金属ケーシングを備えています。 これらのカラムは室温で動作し、長さは50〜250センチメートルの範囲です。
ガスクロマトグラフィーでは、システムに注入されたサンプルは、カラムに運ばれる前に華氏約400度で気化されます。 したがって、化合物は、別の分子に分解または分解することなく、高温での熱に耐えることができなければなりません。 液体クロマトグラフィーシステムでは、サンプルが熱にさらされないため、科学者はより大きく安定性の低い化合物を分析できます。