サンゴ礁は水中の生態系であり、サンゴの骨格でできた大きな岩の尾根です。 サンゴは、個々にポリープとして知られている海洋無脊椎動物（背骨のない動物）です。 彼らは実際にすべてのサンゴ礁の動物の中で最も一般的です。 何千ものポリプがコロニーに共存し、非常に長期間にわたって炭酸カルシウムの外骨格を排出し、サンゴ礁の構造を作り出します。 サンゴ礁の植物はすべて、生態系内に見られる光合成生物です。
サンゴ礁の藻
最も豊富なサンゴ礁の植物は藻類であり、最も一般的に知られている種類の藻類は褐虫藻、微視的な単細胞の緑藻です。 褐虫藻はサンゴの組織内に生息し、ハードコーラルが炭酸カルシウムを生成してサンゴ礁を構築するのを助けます。 褐虫藻は、光合成（光エネルギーを化学エネルギーに変換するプロセス）を通じて、サンゴに食物と酸素を供給します。
多細胞藻類には、サンゴと石灰質の2種類があります。 サンゴモは、組織内に長くて細い炭酸カルシウムの糸を含み、それがサンゴ礁の表面全体に広がり、砂の堆積物を閉じ込め、砂の粒子を結合します。 これにより、サンゴ礁の構造が支えられ、強化されます。 サンゴモは通常直立して成長し、死ぬと砂を生成します。
サンゴ礁の海藻
大型の海藻は一般に「海藻」と呼ばれています。 厳密に言えば、すべての種類の海藻が植物であると見なされるわけではありません。 海藻の3つの主なタイプは色に基づいています：緑の海藻、紅の海藻、茶色の海藻。 各色は、さまざまな深さの太陽光を最大限に活用するように設計された光合成色素で構成されています。
緑藻は浅いサンゴ礁地域で最も一般的であり、通常は岩礁の表面に見られます。 サンゴ礁システムで見られる最も豊富な種類の緑の海藻の2つは、ウルバ（アオサ）とカウレルパ（海のブドウ）です。
紅藻は緑藻と密接に関連しており、フォアリーフの150フィートを超える深さまでの最も浅いリーフフラットで見つかる可能性があります。 紅藻の最も一般的なタイプは痂状サンゴモ（CCA）で、その生物は炭酸カルシウムを生成し、サンゴ自体と同様にサンゴ礁の形成を処理するのに役立ちます。
褐藻はもはや植物とは見なされていませんが、ストラメノパイルとして知られる多様な生物群の一部です。 褐藻はサンゴ礁に見られますが、赤や緑の海藻ほど豊富ではなく、多様性もありません。
「サンゴ礁の海藻」は、サンゴ礁に生息する無数の海洋植物や藻類の総称としても使用されます。
サンゴ礁の顕花植物
サンゴ礁の顕花植物には、マングローブと海草の2種類があります。 それらは両方とも急速に成長し、サンゴ礁の動物に餌を提供します。 また、水の動きを減速させることにより、水中の堆積物の蓄積を減らします。
海草は通常、サンゴ礁のラグーンの浅く保護された水域に見られ、コンパクトで広大な海草の牧草地を形成します。 ウミガメ、マナティー、ジュゴン、そしていくつかの魚は海草を食べ、巻き貝やアカザエビのような若い海の動物は彼らの刃の中に避難します。
マングローブは、熱帯および亜熱帯の海岸に沿って厚い「森」を形成する、大きな低木のような植物です。 他の多くの「陸上」植物とは異なり、塩分をろ過する根と塩分を除去する葉のおかげで、塩分条件に耐え、海水に完全に浸るように進化しました。