ההבדל בין מיצוי ה- DNA הגנומי בין בעלי חיים לצמח

מבנה ה- DNA הדו-גדילי הוא אוניברסלי בכל התאים החיים, אך הבדלים מתרחשים בשיטות להפקת DNA גנומי מתאי בעלי חיים וצמחים. למרות ש- DNA גנומי חי בגרעין התאים, הכמות והטוהר של ה- DNA המופק תלויה בסוג התא ובגודל שלו. לדוגמא, תאים מסוימים מכילים יותר DNA וזיהומים מאחרים. המשך לקרוא כדי ללמוד עוד על הבדלי חילוץ DNA.

אם אתה מטפל בתאים צמחיים ובעלי חיים עם חומר סבוני, זה ישפיל את הליפידים בתא ובקרום הגרעיני. לאחר מכן תערובת ה- DNA תיפרד מקרומי התא והחלבונים. לאחר מכן, אתה יכול להשתמש באלכוהול כדי לזרז את ה- DNA בתמיסה. בהתאם לכמות בדגימה, DNA עשוי להיראות בעין בלתי מזוינת. עם זאת, יש לזכור כי הליך פשוט זה אינו מייצר בהכרח DNA בעל טוהר גבוה.

תאי הצמח שונים מתאי בעלי חיים בגלל דופן התא הנוקשה והאברונים שלהם כמו הכלורופלסט. הם מכילים גם חלבונים ואנזימים הממלאים תפקיד בפוטוסינתזה. לחלק מתאי הצמח יש פוליפלואידיות, כלומר יש להם יותר מעותק אחד של כל כרומוזום לכל תא. בנוסף, תהליכים תאיים המתרחשים בצמחים כגון פוטוסינתזה מייצרים מגוון מטבוליטים משניים. לתאים של בעלי חיים אין דופן תאים, אך הם עדיין זקוקים לכימיקלים כמו נתרן דודסיל סולפט (SDS) כדי לשבש את קרום התא כדי לשחרר DNA גנומי.

דנ"א גנומי מהצומח קשה יותר לחילוץ בגלל דופן התא של הצמח. ניתן להסיר אותו על ידי הומוגניזציה או על ידי הוספת תאית כדי להשפיל את התאית המרכיבה את דופן התא. בנוסף, המטבוליטים הנמצאים בתא הצמח עשויים להפריע למיצוי ה- DNA הגנומי על ידי זיהום דגימת ה- DNA במהלך תהליך המשקעים.

לויקוציטים בדם היקפיים הם המקור העיקרי ל- DNA גנומי של בעלי חיים, אך איסוף הדגימות קשה מכיוון שהדם חייב להגיע ישירות מהחי. הדם מכיל מגוון של תרכובות כמו חלבונים, שומנים, כדוריות דם לבנות, כדוריות דם אדומות, טסיות דם ופלסמה, העלולים לזהם את דגימת ה- DNA. עם זאת, המזהם העיקרי של DNA מהחי שמופק מדגימות דם הוא heme, שהוא המרכיב הלא-חלבוני של ההמוגלובין.

ההבדלים בין DNA צמחי לבעלי חיים נעוצים ברצף הבסיסים בסליל. תרכובות שנמצאו בתאי צמח נעדרות בתאי בעלי חיים, ורצפי בסיס ה- DNA משקפים זאת. כמו כן, ה- DNA של הצמח הגנומי לרוב גדול יותר מ- DNA של בעלי חיים. הבדלים אלה משפיעים גם על שיטות החילוץ, על התשואה ועל טוהר ה- DNA.