כיצד להבין תוצאות ציטומטריה של זרימה

מדענים משתמשים בציטומטריית זרימה כדי להבדיל בין סוגים שונים של תאים או אורגניזמים מיקרוסקופיים. זהו כלי המשמש ביישומים רבים כגון אבחון רפואי או פתולוגיה משפטית. אמנם קל למדי לבצע טכניקה ניסיונית זו, אך הניתוח של הנתונים המורכבים הופק על ידי ציטומטר הזרימה קשה יותר בשל גורמי הניסוי המרובים ו / או הציטומטר פרמטרים. ככזה, באופן שגרתי ניתן לדמיין ולנתח נתונים ציטומטריים באמצעות תוכניות מקצועיות מתוחכמות כגון CELLQuest או FlowJo. היכרות עם טכניקות, מכונות ותוכנות של ציטומטריית זרימה נחוצה על מנת להבין את התוצאות המופקות על ידי אלה ניסויים.

הבהיר את מטרת הניסוי על ידי שאלת "מה נחקרה השאלה או ההשערה?" זה יהיה נדרש להתאים את התוצאות הגולמיות לתבנית ולהגדרות המתאימות לניתוח נוסף באמצעות ציטומטריה סטטיסטית תוֹכנָה. בצע את כל השינויים הדרושים על מנת להציג את הנתונים עם ההגדרות הרלוונטיות (למשל תאים חיוביים, שערים שליליים, עוצמת פלואורסצנטי, אוכלוסיות תאים וכו ').

מצא שערים. תאים יכולים להיות מקובצים או פשוט נצפו באשכול על עלילת צפיפות או תרשים מתאר. לעתים קרובות הקבוצות נפרדות בהתאם לזהותן. אם קבוצה אחת מכתימה באופן אינטנסיבי מאוד לסמן או נוגדן מסוים, המסקנה היא כי לחברים בקבוצה זו יש זהות לסוג התא הספציפי, המבטא את אותו סמן. מקובל למצוא תאים חיוביים ליותר מאחד מהסמנים הללו, ותאים אלו הם בדרך כלל ביניים ומסומנים כ"חיובי כפול ".

instagram story viewer

תסתכל על פיזורי תמונות. האופן בו קבוצות התאים מתפשטות בעלילת פיזור היא אינדיקציה לגודל התאים. תאים עם פיזור גדול מאוד או גבוה הם בדרך כלל תאים גדולים; עם זאת, הם עשויים להיות גדולים פשוט משום שהם מכילים שיעור גבוה של ציטופלזמה, או שהם עשויים להיות גבוהים מכיוון שיש להם גרעין גדול מאוד. בהתאם לביולוגיה הנחקרת, זה כמובן ישתנה מאוד בין הניסויים.

תסתכל על מספרים. התאם את העלילות להצגת פרמטרים שונים על ציר אחד (בדרך כלל ציר ה- X) תוך שמירה על הספירות על ציר Y. זה מציין את החלק מאוכלוסיית המדגם החיובי עבור אותו פרמטר מסוים, כ- שיא נצפה בדרך כלל במדגם מוכתם באופן חיובי, שייעדר מהבקרה השלילית לִטעוֹם.

עיין בהיסטוגרמות מרובות פרמטרים. על ידי התאמת ציר ה- X וציר ה- Y לכל אחד מהם מייצגים פרמטר אחר שהיה שנחקר במהלך הניסוי, ניתן להבין יותר טוב את המאפיינים של המדגם. לדוגמה, על ידי הגדרת ציר ה- X לקרינה אדומה וציר ה- Y לקרינה ירוקה, ניתן לחשב שערים בסגנון הרבע עבור מדגם כדי להציג ארבעה אזורים של רבע בהם קיימים תאים ומוכתמים לפלואורסצנטיות אדומות או ירוקות, בשני הצבעים, או ללא את כל. זה מאפשר לחלק מדגם הטרוגני לחלקים המרכיבים שלו ולכלל ישויות חופפות ולכמת.

הפניות

  • "ניתוח נתוני ציטומטריה זרימה"; סוזן שרו; 1991
  • "ציטומטריית זרימה: מכשור וניתוח נתונים"; מרווין ואן דילה; 1985
  • "פרוטוקולי ציטומטריית זרימה"; תרזה ורוברט האולי; 2004

על הסופר

פאלמר אוויונג הוא בעל תואר שני בעסקים בינלאומיים מאוניברסיטת קליפורניה בסן דייגו בוגר תואר ראשון באמנויות בסוציולוגיה מאוניברסיטת קליפורניה בסנטה ברברה והינו מולקולרי מאומן ביולוג. הוא סופר עצמאי מאז 2006. בנוסף לכתיבה, הוא סוחר פורקס במשרה מלאה ומשווק באינטרנט.

נקודות זיכוי

פולקה דוט RF / פולקה דוט / Getty Images

Teachs.ru
  • לַחֲלוֹק
instagram viewer