התחל את תהליך זיהוי החיידקים הלא ידועים על ידי התבוננות במאפייניהם הפיזיים, כגון דופן התא, צורתם וקשריהם. השתמש בהליכי מעבדה סטנדרטיים, כמו צביעת תאים, גידול ורצף DNA כדי לצמצם עוד יותר את הזיהוי שלך. חיידקים מקובצים בדרך כלל למינים על פי המאפיינים הפיזיים והמטבוליים שלהם, ולא על פי היחסים הגנטיים שלהם זה לזה.
חיובי או שלילי
החיידקים הם מה שמכונה חיידקים אמיתיים. הם נבדלים מארכאים או ארכיבקטריות, המהווים ממלכה נפרדת. חיידקים הם פרוקריוטים, כלומר חסר להם קרום גרעיני. לרובם ממברנות תאים וקירות תאים. חיידקים עם קירות תאים עבים מכונים חיובי גרם משום שהם רגישים למות במהלך בדיקה הנקראת כתם גרם. כתם הגראם הוא הבדיקה הראשונה בה נעשה שימוש בסיווג חיידקים. חיידקים עם קירות תאים דקים או נעדרים הם שליליים בגרם מכיוון שהם אינם לוכדים את צבע הכתם גרם.
עיצוב חיידקים
חיידקים כדוריים מכונים קוקי, חיידקים היוצרים מוטות ישרים נקראים צמחים וחיידקים בעלי צורת ביניים נקראים קוקובצילי. כל אלה יכולים להיות גרם שלילי או חיובי גרם. חיידקים קשיחים בצורת ספירלה מכונים ספירילה והם שליליים בלבד. חיידקים גמישים, ניידים באופן עצמאי, בצורת ספירלה, נקראים ספירוכטים והם ניטרליים גרם. לבסוף, מוטות קשיחים בצורת פסיק נקראים vibrios והם שליליים בגרם. לכמה חיידקים מעט מוכרים ובלתי מובנים יש צורות שונות, כמו סטלה בצורת כוכב ובלונים בצורת גרזן. ישנן גם שתי קבוצות חיידקים ביניים. Rickettsia דומים לווירוסים, בעלי מגוון צורות, הם שליליים בגרם ויכולים לשרוד רק בתוך תאים אחרים. Mycoplasma, הדומים לפטריות, חסרים דפנות תאים וכוללים פתוגני ריאה רבים הספציפיים למין, דלקת ריאות.
קוביות, אשכולות וקישורים אחרים
Cocci ו bacilli מסווגים עוד על ידי הצמרות שהם יוצרים לאחר חלוקת התא. דיפלוקוקים ודיפלובצילים נדבקים יחד בזוגות. סטרפטוקוקים וסטרפטובצילי יוצרים שרשראות. קוקי טטראד נשארים בריבועים של ארבעה חיידקים. קוצ'י סרצ'ינה יוצרים קוביות של שמונה חיידקים וקבוצות סטפילוקוקיות.
זיהוי החיידק
אם יש לך חיידק לא ידוע ואתה רוצה לזהות אותו, בדרך כלל תבצע כתם גרם ואז תצפה במראה המושבה ובמאפיינים האישיים. בשלב זה, אתה יכול לומר שיש לך, למשל, סטרפטובצילי שלילי גרם. לאחר מכן תוכל להשוות את הדגימה שלך לחיידקים ידועים שונים על ידי הצבתם בתקשורת תרבותית שונה לעודד צמיחה של מינים מסוימים ולעכב אחרים, או על ידי בדיקת המדגם לאיתור חיידקים ידועים שונים תוצרי לוואי. כמוצא אחרון, רצף דנ"א יכול לקבוע אם יש לך זן או זן חיידקי ידוע או לא ידוע, בתנאי שאתה משווה אותו למין או זן שהגנום שלו כבר רצף.