המערכת האקולוגית של פלורידה קיז מורכבת מבתי גידול מגוונים, כולל מנגרובים, שוניות אלמוגים ואדמות אורות, העשירים במינים ייחודיים. גם בני אדם הם חלק מהמערכת האקולוגית, ופעילותם משפיעה על כל בתי הגידול ועל בעלי החיים והצמחים השוכנים בהם. המערכת האקולוגית של קיז מורכבת משטח קטן של אדמה, ולכן ההשפעות של פעילויות אנושיות מוגדלות. ההשפעות כוללות זיהום מים, מינים פולשניים מוגברים, דיג יתר, השפעות שליליות מהשייט והפיתוח העירוני ושינויי אקלים עולמיים.
האוכלוסייה האנושית באזור המכונה דרום מזרח פלורידה או פלורידה קיז גדלה ביותר מ -3.9 מיליון בשנים 1970-2008. מטעי תפוזים פינו את מקומם לפיתוח דיור, קניוני חשפנות, תעשייה וכבישים מהירים. שינויים אלה הביאו להרס בתי גידול טבעיים. בנוסף, זיהום המים גדל, שנגרם על ידי טיפול בשפכים והצפת ספיגה ונגר מי סערה המכילים נפט, חומרי הדברה ומתכות כבדות.
בשנת 2010 היו 3.8 מיליון מבקרים במפתחות. רבים מהמבקרים הללו עסקו בפעילות כמו דיג. בנוסף לתיירים ולתושבים העוסקים בפעילויות פנאי אלה, דיג מסחרי הוא ענף גדול באזור. דיג יתר דלדל מינים במערכת האקולוגית של קיז, והשאיר דגים קטנים יותר ושינה את יחסי הגומלין של רשת המזון המורכבת.
שייט באזור הוביל לא רק לפציעות ישירות של יומנים שנגרמו על ידי מדחפים, אלא שהמדחפים צלקו גם שטחים גדולים של עשב ים. סירות עלו על שרטון ופוגעות בשוניות האלמוגים כאשר עוגנים מגרדים על פני תצורות עדינות אלה. יותר מ -500 הארקה מתרחשת מדי שנה במפתחות. זה הורס בית גידול ומשפיע לרעה על כל שרשרת המזון, מה שמוביל לאובדן מינים נוסף.
כאשר בני אדם עוברים, הם מביאים עמם מינים מאזורים אחרים העלולים להשתחרר למערכת האקולוגית. מינים אלו יכולים להתגורר ומכיוון שאין להם טורפים, להפוך למינים מקומיים מצליחים מאוד ומתחרים ומשנים את הדינמיקה של המערכת האקולוגית כולה. בעלי חיים וצמחים פולשניים בפלורידה קיז כוללים את דגי האריות ודשא גינאה. בנוסף לכל ההשפעות המקומיות הישירות והעקיפות הללו, צפויות השפעות ההתחממות הגלובלית לחמם את המים האזור ב -4 עד 10 מעלות פרנהייט ומעלה את מפלס הים, ואולי גורם לשינויים מהירים מדי מכדי שהמערכת האקולוגית תצליח לְתַקֵן.