הכנת מולקולות מרשמלו היא דרך מעשית ללמוד וללמוד את המבנים של מולקולות שונות. יצירתם היא פרויקט קל, מהנה ונפלא לילדים מכיוון שהתוצר הסופי אכיל. יצירת המולקולות חלק אחר חלק היא הדרך המושלמת ללמוד מבנים שלהן באופן חזותי. בין מולקולות המרשמלו הבסיסיות לייצור ניתן למנות מים, פחמן דו חמצני ופחמן חד חמצני.
שטפו את הידיים לפני שפותחים שקית מרשמלו צבעונית ומחלקים את כל הצבעים השונים לערימות נפרדות. צריכות להיות ארבע ערימות: ורוד, כתום, ירוק וצהוב. הקצה לכל אחד מהצבעים אלמנט מסוים. לדוגמא, המרשמלו הוורוד יכול לייצג חנקן, כתום יכול להיות חמצן, ירוק יכול להיות מימן וצהוב יכול להיות פחמן.
עיין בתרשים של המולקולה שברצונך לבנות. כל מולקולה מורכבת מאטומים שונים במספרים משתנים. לדוגמא, מולקולת מים מוצגת כ- H20, כלומר יש לה שני אטומי מימן ואטום חמצן אחד.
קח שני מרשמלו ירוק ומרשמלו כתום אחד, שייצג את מרכיבי מולקולת H2O. חוררים את המרשמלו הכתום בשני קיסמים, שכל אחד מהם מכוון כלפי מעלה ומרוחק זה מזה. צרף מרשמלו ירוק לקצוות הפתוחים של שני קיסמי השיניים. המבנה מייצג כעת במדויק מולקולת מים. חזור על הפעולה עם כל מולקולה שתרצה, היצמד לקוד הצבע והרכיב את המולקולות בהתאם לתרשימים שלהן.