ההשפעה העיקרית של הרס בתי גידול היא צמצום המגוון הביולוגי, המתייחס למגוון ולשפע של מינים שונים של בעלי חיים וצמחים בסביבה מסוימת. כאשר בעל חיים מאבד את הבית הטבעי או בית הגידול שהוא זקוק לו כדי לשרוד, מספרו יורד במהירות והוא עובר לעבר הכחדה. ההערכה היא כי 14,000 עד 35,000 מינים נמצאים בסכנת הכחדה, והרס בתי גידול הוא אחד הגורמים העיקריים.
האבקה ופיזור זרעים
צמחי בר וחקלאות תלויים בהאבקה לצורך רבייה. פירות וירקות, מרכיבי מפתח בתזונת האדם, תלויים בדבורים ובחרקים אחרים כדי להעביר אבקה מפרח לפרח. כאשר הרס בתי גידול מפחית את הזנים של המאביקים הללו, גם יבול היבול יורד. לדוגמא, דבורים חסרות עוקץ בקוסטה ריקה המקננות רק ביערות מגדילות את התשואה במטעי קפה הממוקמים בסמוך לטלאי יער ב -20 אחוזים. צמחים רבים מסתמכים גם על בעלי חיים, במיוחד כאלה שאוכלים פירות, לפיזור הזרעים. הרס בית הגידול של בעלי חיים מסוג זה יכול להשפיע קשות על מיני הצמחים התלויים בהם.
תקנת אקלים
המגוון הביולוגי משפיע על האקלים בעיקר באמצעות ויסות כמות הפחמן הדו-חמצני באטמוספירה. הרס בתי גידול ביער מצמצם את יכולתם לספוג פחמן דו חמצני ביערות. קצב הגדילה והעצינות של הצמח קובע את קצב מחזור הפחמן בתוכו. דפוסי נוף חשובים גם מכיוון שהצבת פחמן מצטמצמת בשולי שברי היער. מערכות אקולוגיות ימיות ממלאות תפקיד משמעותי גם בהפסקת הפחמן.
הדברת מזיקים ומחלות
מזיקים לעיתים קרובות מכוונים לסוגים ספציפיים של צמחים. כאשר בתי גידול נהרסים ומגוון הצמחים מצטמצם, הסביבה מכילה יותר סוג מסוים של צמחים. זה מקל על התפשטות המזיקים. מגוון הצמחים מספק בתי גידול למגוון גדול יותר של חרקים ובעלי חיים אחרים ולאויבים הטבעיים של מזיקים. מחלות של צמחים פטרייתיים חמורות יותר באזורים חד-תרבותיים בהם מעובדים סוג יחיד של גידולים.
השפעות עקיפות
ייצור מזון, ביגוד ומקלט לבני אדם תלוי בדרכים עקיפות רבות במגוון הביולוגי של מערכות אקולוגיות. מגוון גבוה של גידולים חקלאיים מגן על החקלאים מפני כשלים בגידולים. הרס בתי גידול וצמצום מגוון המינים יכולים להפוך מערכות אקולוגיות לפגיעות יותר למינים פולשניים ולהשפיע בעקיפין על בריאות האדם ורווחתו. ההשפעה של מינים פולשים מודגמת על ידי מה שקרה כאשר הבס הוחדר לאגם גאטון, פנמה. נוכחות הבס הביאה להפחתת טורפים של זחלי יתושים ולעלייה בשכיחות המלריה.