ישנם בעלי חיים רבים בסכנת הכחדה בכל בית גידול בעולם, כולל ביומיות מים מתוקים. ביומים של מים מתוקים הם מקומות מים עם ריכוז מלח נמוך. בתי גידול מסוג זה כוללים נחלים, נהרות, בריכות, אגמים ושטחי מים. יונקים, זוחלים ומיני דגים נמצאים בסכנת הכחדה בביומים רבים של מים מתוקים ברחבי העולם.
סוּס הַיְאוֹר
•••Jupiterimages / Photos.com / Getty Images
השם היווני להיפופוטם הוא "סוס נהר". הוא נמצא ברחבי אפריקה בנהרות ובאגמים. הוא מבלה עד 16 שעות ביום במים מתוקים כדי לשמור על קרירות גופו. הוא הולך על ערוץ הנהר או שוכב במים רדודים. בלילה היפופוטמים נוסעים בתיק יחיד עד שישה קילומטרים על היבשה לרעות. היפופוטמים הוכנסו לרשימת המינים בסכנת הכחדה בשנת 2006. האיום הגדול ביותר על המין הוא מצד ציידים שהורגים בגלל שנהב בשיניו.
תנין אמריקאי
•••Jupiterimages / Photos.com / Getty Images
התנין האמריקאי הוא זן זוחלים המצוי במערב מקסיקו, אקוודור ודרום פלורידה. יש לו זנב ארוך וגוף שרירי הגולש במים. יש לו גם כפות רגליים על מנת לאפשר לו ללכת על היבשה. התנין האמריקאי ניזון מדגים, חרקים, זוחלים וציפורים. הוא משתמש בלסתו החזקה ובשורות של שיניים חדות כדי לתפוס את טרפו. לאחר שנתפס, הוא גורר את הטרף מתחת למים ומתאבק עד שהטרף מת. בעבר הוא נצוד על ידי בני אדם על עורו, ועכשיו הוא מאוים בגלל אובדן בית הגידול של הביצה שלו.
צבי קופסא קואילאן
צב הקופסה של קוהילאן הוא יליד שטחי הביצה של קוטרו סינגס במקסיקו. הוא מבלה 90 אחוז מזמנו במים מתוקים כדי לשמור על קור רוח מהשמש של המדבר. ניתן למצוא אותו בנהרות, בבריכות ובמעיינות. צבים אלה ניזונים מחרקים וצמחים ואינם אוהבים להתרחק הרחק מבתיהם. ההערכה היא כי רק כמה אלפים נותרו במקסיקו. הסיבה לכך היא שבית הגידול שלו אבד בגלל השקיה ובצורת.
פרת ים
•••Jupiterimages / Photos.com / Getty Images
ים ים הם יונקים החיים בנהרות באפריקה ובדרום אמריקה. איש ים חי בזוגות או בקבוצות קטנות. כמו כל היונקים הימיים, הוא חייב לנשום על פני המים אך אחרת חי במים כל הזמן. יש לו זנב חזק שיעזור לו לנסוע במהירות של 5 מייל לשעה בממוצע. הוא נולד מתחת למים ותוך שעה יכול לשחות ללא עזרה. הוא אוכל עשבים שוטים, אצות ועשב מים וחי עד 40 שנים בטבע. ים ים הם בסכנת הכחדה בגלל אובדן בית גידול והם נמצאים בסיכון להיהרג על ידי מדחפי סירות מנוע.
סטריית מים מתוקים של מקונג
בקתת המים המתוקים של מקונג ממוקמת במערכות הנהר מקונג וצ'או פראיה. זהו אחד הדגים הגדולים בעולם. יש לו גוף רחב ושטוח עם סנפירים דמויי כנפיים. הוא ניזון מחסרי חוליות השוכנים בקרקעית מכיוון שהוא מבלה זמן רב על קרקעית ערוצי הנהר. מצוקת המים המתוקים של מקונג נמצאת בסכנה בגלל דיג יתר. הוא נמכר כמעדן, ולעיתים סטינגרים נלכדים בלי כוונה ברשתות דיג.