כמו רוב הביומיות על כדור הארץ, המערכת האקולוגית הסוואנית שורדת באיזון עדין בין גורמים סביבתיים למינים שונים, כולל בני אדם. בצורת קשה עלולה לשדוד את עשב הדשא של המים והעלווה שלהם, בעוד ציידים ו לעיתים קרובות ילידים מאיימים לשבש את רשת המזון באמצעות הרג של בעלי חיים לצורך ספורט או הישרדות.
פעילויות אנוש
פעילויות אנושיות עלולות לאיים קשות על שיבוש מערכות אקולוגיות של סוואנות. שימוש במים והשקיה בלתי-קיימא עלול לייבש נהרות וחורי מים. באזורים שבהם ילידים מכילים באופן קבוע בשר בוש - בשר בר - בתזונה שלהם, אוכלוסיות בעלי גולים ירדו בשיעורים ניכרים. כמה חיות בר של סוואנה ניצודות גם כגביעים; קרנפים שחורים, במיוחד, ניצודים על קרניהם היקרות. אפילו כמה מיני צמחים נקצרים יתר על המידה בשל ערכם המסחרי. גילופים עשויים בלקווד אפריקאי, עץ סוואנה, נמכרים לעיתים קרובות בשווקי התיירים.
בצורת ומרעה כבד
לבצורת קשה וממושכת יש השפעה מסוכנת על מערכת אקולוגית של סוואנה, כאשר דפוסי מרעה מחריפים את האפקט הזה. השילוב של בצורת קשה ורעייה יכול לשנות עשב של עשבים אכילים, רב שנתיים בעיקר לסוואנה הנשלטת על ידי עשבים וצמחים שאינם אכילים. שטחי עשב רעים קלות שומרים על איכותם של מיני דשא רב-עיניים טעימים, אך עדיין ניתן לשנות את האיפור של מיני צמחים. מומחים קראו לפתרונות לניהול מרעה במהלך פרקי הבצורת כדי להשפיע על כיוון השינוי הפוטנציאלי לעבר קיימות הדשא.
מדבור
סוואנות טרופיות גובלות לעיתים קרובות באזורים צחיחים ומדבריים, והתפשטות תנאים דמויי מדבר לאזורי עשב יבשים נקראת מדבריה. איום זה על מערכת אקולוגית של סוואנה כולל השפעות הנגרמות על ידי שינויי אקלים, שיטות חקלאות, רעיית יתר, השקיה חקלאית אגרסיבית, המורידה את מפלס שולחן המים הרחק משורשי הצמח, כריתת יערות ו שְׁחִיקָה. מדי שנה הופכים מעל 46,000 קמ"ר של סוואנה אפריקאית למדברית. נטיעת צמחים עמידים לבצורת עלולה לייצב דיונות חול משתנות ולהתחיל ריבוי צמחייה נוספת.
פליטת פחמן
סקר משנת 2012 ייחס גידולים גדולים במסת הצמחים העצים ל"אפקט ההפריה של CO2 ". המחברים הניחו כי העלייה בקצב גידול הצמחים העצי נגרמה כתוצאה מגידול פחמן אטמוספרי דוּ תַחמוֹצֶת. עלייה דרמטית בכמות העצים והשיחים עלולה לאיים על כל המערכת האקולוגית של הסוואנה, מכיוון שצמחים אלה משתמשים ביותר מים מאשר עשבים. אנשי שימור בנמיביה דיווחו כי צמחים עציים פוגעים גם באנטילופות וגם ב הברדלסים הצדים אותם - התפתחות שעלולה להיות לה השלכות לא ידועות ברחבי שטחי מרעה.