מישיגן גובלת בשלושה מהאגמים הגדולים - סופריור, הורון ומישיגן - המספקים בית גידול מתאים לציפורים של ביצות. מדינת וולברין מציגה גם יערות לאומיים, כמו מאניסטה והורון, לציפורים שוכנות בקרקע. חובבי ציפורים עשויים להצטרף לחברת אודובון של מישיגן (michiganaudubon.org), ארגון המגביר את המודעות לשימור הציפורים במדינה ומציע תוכניות חינוך אורניטולוגיות.
Ciconiiformes
צו ה- Ciconiiformes כולל את כל הציפורים המשכשכות במישיגן. ציפורי שכשוך הם ציפורים ארוכות רגליים המשכשכות, או הולכות לאט, במים בחיפוש אחר מזון. רוב הציקוניפורמים הם אוכלי כל, כלומר אוכלים צמחייה ובשר. אגמים, נהרות וביצות הם בתי גידול נפוצים עבור עופות Ciconiiformes. לצורך קינון, ציפורים אלה בדרך כלל מוצאות כתמים על גדות האגם או על גדות הנהר. רשימת המינים Ciconiiformes של מישיגן כוללת איביס לבן פנים, חסידות עץ, אנפת לילה עטורת שחור, אנפה מושלגת ומרה אמריקאית. מרבית העופות המשכשכים, כמו האנפה הכחולה הגדולה, הם בעיקר ציפורים נודדות.
Pelecaniformes
במישיגן מתגוררים כמה מינים בסדר Pelecaniformes. במהלך החורף, Pelecaniformes חי ליד האוקיאנוסים הגדולים של מי המלח והשפכים. ציפורים אלה נוהרות למישיגן בקיץ ומתגוררות ליד אגם מישיגן ואגם סופריור. רוב עופות הפלקניפורמים הם טורפים, וניזונים מדגים קטנים. כדי לאחסן את הטרף שלהם, לפלקניפורמים יש כתמי גומי, או פלטות עור רופפות באזור הגרון. שקנאים חומים, קורמורנים כפולים וערמות צפוניות הם כמה עופות של Pelecaniformes שנראים לעתים קרובות בקיץ. הקורמורנים הכפוליים הם הקורמורנים היחידים החיים במישיגן.
פלקונפורמים
כל עופות הטרף של מישיגן, או דורסים, שייכים למסדר הפלקוניפורמים. ציידים טורפים לחלוטין אלה טורפים נחשים, עופות קטנים, יונקים ודגים. הטאלונים החדים שלהם תופסים את טרפם, והמקור המחודד שלהם מאפשר להם לזלול בשר בקלות. עופות דורסים הם יומיים, כלומר פעילים במהלך היום. מאחר ועופות אלה צדים בראייה, היום הוא המתאים ביותר עבור עופות דורסים לצוד. בין מיני עופות הדורסים של מישיגן נצים זנב אדום, צואה אמריקאית, גושן צפוני והנשר הקירח.
גליפורמים
גליפורמים הם סדר מיני ציפורים הדורשות קרקע כבדה. יש להם יכולת טיסה, אך בדרך כלל נשארים על הקרקע בחיפוש אחר מזון ואתרי קינון. אתרי קינון של ציפורי גליפורמיס הם בדרך כלל בקתות המכוסות על ידי עצים או אזורי דשא גבוהים. מרבית העופות של גליפורם נשארים במישיגן לאורך כל השנה. אחת ההודו הנפוצות ביותר בארצות הברית, תרנגול ההודו המזרחי, היא ילידת מישיגן. אחרים הנפוצים במישיגן הם הבובוויט הצפוני, הפסיון הטבעתי והזנב החדה.
Passeriformes
ציפורים קטנות ועגומות רבות - כאלה שחיות על עצים - נופלות תחת פקודת Passeriformes. אלה ידועים גם כציפורים יושבות או ציפורי שיר. ל- Passeriformes יש יותר מינים מכל סדר ציפורים אחר במערכת הסיווג לינאית. לפעמים ציפורים אלה מטאטאות על הקרקע למאכל, אך כל הפאסרפורמים מקננים בענפי עצים. לוכדי זבובים, ציפורי מלך, וירוסים, שריקות, סנוניות וצ'יקיידים הם כמה מהציפורים הסוריות של מישיגן.