Come calcolare il punto isoelettrico dei peptidi

I peptidi sono brevi frammenti polimerici composti da amminoacidi. Ogni peptide ha una certa sequenza di amminoacidi indicata con un codice di tre lettere o una lettera; per esempio l'aminoacido alanina è abbreviato come "Ala" o "A". La carica dei peptidi nella soluzione dipende dall'acidità della soluzione. Il punto isoelettrico (pI) si riferisce al valore di acidità della soluzione al quale la molecola peptidica ha carica netta pari a zero. La solubilità del peptide è minima al punto isoelettrico. Utilizzare i server Web disponibili per calcolare il valore pI per una sequenza di amminoacidi peptidici.

Scrivi la sequenza del peptide usando il codice a una lettera. Ad esempio, se un peptide ha una sequenza di amminoacidi Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanina—Serin—Acido Glumatico—Leucina—Prolina), quindi la sequenza di una lettera è "ASELP". Se necessario, consultare la tabella di conversione da tre lettere a una lettera fornita in Risorse.

Utilizzare qualsiasi browser Web, Internet Explorer o Firefox, ad esempio, per navigare verso un server che calcola il punto isoelettrico del peptide (pI); vedere Risorse.

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Leggere il valore del punto isoelettrico (pI) riportato nella riga "pI/Mw teorico". Nel nostro esempio, il pI è 4.00. Nota che il server calcola anche il peso molecolare (Mw) del peptide.

Circa l'autore

Oxana Fox è una scrittrice freelance specializzata in medicina e cure, software e hardware per computer, fotografia digitale e servizi finanziari. Si è laureata al Moscow Medical College nel 1988 con una formazione formale in pediatria.

Crediti fotografici

Immagini Comstock/Comstock/Getty Images

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