Gli ambienti di acqua dolce e marina segnano una rottura primaria negli ecosistemi acquatici; gli ambienti marini contengono un alto livello di salinità (concentrazione di sale), mentre le aree di acqua dolce di solito contengono meno dell'1%. Gli ecosistemi di acqua dolce includono stagni e laghi, nonché fiumi e torrenti. Gli ecosistemi marini includono oceani e barriere coralline.
Stagni e laghi
Stagni e laghi sono corpi d'acqua relativamente fermi con poca o nessuna corrente, generalmente isolati da altri corpi idrici come fiumi e oceani. Sono divisi in tre zone distinte: litorale, limnetico e profondo. La zona litoranea costituisce quella più vicina alla riva. Con un'elevata esposizione alla luce solare e acque poco profonde, questa è solitamente l'area biologicamente più diversificata in un dato lago o stagno, che ospita diverse specie di anfibi, uccelli acquatici, crostacei, insetti, pesci e alghe, sia galleggianti che radicati impianti. La zona limnetica comprende l'area di un lago/stagno più lontana dalla riva ma più vicina alla superficie dell'acqua. Quest'area è meno diversificata della zona litoranea, ma più di quella profonda per l'elevata esposizione al sole. La zona profonda comprende l'area più profonda di uno stagno o di un lago. La vita profonda è quasi esclusivamente dominata da batteri in decomposizione e plancton.
Fiumi e torrenti
Fiumi e torrenti sono corpi d'acqua in movimento che sgorgano da una sorgente, come una sorgente o uno scioglimento ghiacciaio, a una foce, che potrebbe trovarsi in un oceano, in un ruscello o fiume più grande o in qualche altro tipo di serbatoio. Mentre l'acqua viaggia dalla sorgente alla foce, l'ambiente dell'ecosistema cambia drasticamente. La sorgente di un ruscello o fiume ha il più alto livello di purezza e contenuto di ossigeno. Durante il suo percorso, l'acqua impetuosa raccoglie detriti nella sua corrente; quando l'acqua raggiunge la bocca, l'acqua diventa torbida. Di conseguenza, poca luce solare penetra in superficie e la vita delle piante è scarsa. Specie ittiche come il pesce gatto prosperano in queste aree, in grado di sopravvivere in condizioni di scarso ossigeno.
oceani
Gli oceani sono alcuni degli ecosistemi più diversi e geograficamente estesi sulla terra. Gli ecosistemi oceanici sono divisi in quattro zone: intertidale, pelagica, bentonica e abissale. La zona intercotidale comprende le regioni in cui le acque oceaniche incontrano la terraferma. Questa zona è molto dinamica a causa dell'azione costante delle maree. Come regola generale, la diversità delle specie è maggiore nelle zone intertidali che sono più spesso sommerse dall'acqua. Simile alla zona limnetica nei laghi, la zona pelagica comprende l'oceano aperto lontano dalla riva ma più vicino alla superficie dell'acqua. Una varietà di pesci, piante acquatiche e mammiferi più grandi abitano questa regione. Le zone bentoniche e abissali comprendono rispettivamente la seconda e la più profonda regione dell'oceano. A causa della pressione estrema, dell'oscurità e del freddo, queste zone ospitano forme di vita molto diverse. Per sopravvivere a una completa mancanza di luce solare, piante e batteri nella zona abissale raccolgono energia chimica dalle prese d'aria termiche sotto la superficie del fondo oceanico.
Barriere coralline
Gli ecosistemi della barriera corallina sono situati nell'oceano; ma a causa della loro composizione fisica e biologica, sono molto distinti dagli altri ecosistemi marini. Le barriere coralline si formano in acque poco profonde con temperature calde. Molti di questi ecosistemi si sono formati lungo le coste dei continenti. Sebbene possa sembrare un'enorme roccia, una barriera corallina in realtà è costituita da colonie di animali viventi che si fissano in un duro guscio di carbonato di calcio. Queste colonie hanno una relazione simbiotica con le zooxantelle, un tipo di alghe che vive all'interno e fornisce cibo ai coralli. Sebbene racchiudano un'area relativamente piccola, le barriere coralline sono alcuni degli ecosistemi biologicamente più diversificati della terra. Un'immensa varietà di spugne, crostacei, anemoni di mare, pesci, alghe, piante acquatiche e insetti vivono esclusivamente negli ecosistemi delle barriere coralline.