Le femmine di scoiattolo si riproducono accoppiandosi e poi dando alla luce piccoli vivi. Sono in grado di iniziare il processo di accoppiamento all'età di un anno. La prima stagione degli amori inizia alla fine dell'inverno, di solito verso la fine di febbraio. La stagione può durare fino a maggio. La seconda stagione degli amori si verifica alla fine della primavera e dura fino alla fine dell'estate. La maggior parte delle specie di scoiattoli ha due cucciolate; uno alla fine della primavera e uno alla fine dell'estate. Alcune specie sopportano solo un po' una volta all'anno. I cuccioli di scoiattolo si chiamano gattini.
Gli scoiattoli femmine emanano un forte profumo che lo scoiattolo maschio può rilevare. Una volta che lo scoiattolo maschio fiuta la femmina, la inseguirà ad alta velocità attraverso gli alberi. Inoltre schiaffeggerà rumorosamente la corteccia dell'albero con le sue zampe. Se più di un maschio sta inseguendo una femmina, anche i maschi cercheranno spesso di cacciarsi a vicenda. Ciò si traduce in incredibili acrobazie tra gli alberi. La femmina sceglierà il maschio più forte con cui accoppiarsi. Lei sarà in grado di riconoscerlo da quel giorno in poi e si preoccuperà di non accoppiarsi mai più con lui. Dopo l'accoppiamento, lo scoiattolo maschio se ne va per sempre. Non ha niente a che fare con l'allevamento dei gattini.
La cucciolata media di uno scoiattolo è composta da due a cinque gattini. Il periodo di gestazione è di circa sei settimane, sebbene alcune specie di scoiattolo abbiano un periodo di gestazione di appena quattro settimane e altre di otto settimane, come lo scoiattolo grigio e volpe.
Gli scoiattoli, o gattini, sono piccoli alla nascita. Pesano circa un grammo e sono lunghi circa un pollice. Sono glabri, senza denti e sono quasi ciechi per i primi uno o due mesi di vita. Tuttavia, crescono rapidamente e di solito sono completamente svezzati entro le dieci settimane di età. Quando hanno quattro mesi, la maggior parte degli scoiattoli ha lasciato per sempre il nido della madre.