Tingkatan Klasifikasi Mikrobiologi

Pada abad ke-19, taksonomi -- klasifikasi organisme hidup -- sangat populer dalam biologi. Baik naturalis amatir maupun profesional begitu terjebak dalam kegilaan mengumpulkan dan mengidentifikasi makhluk, kumbang langka adalah komoditas panas. Pada saat itu, sedikit yang diketahui tentang mikroorganisme dan tempatnya di dunia makhluk hidup, dan klasifikasi mikrobiologi tidak mendapat banyak perhatian. Dekade intervensi telah melihat peningkatan dramatis dalam pengetahuan tentang mikroba dan metode mengidentifikasi mikroorganisme, dengan bagian dari peningkatan yang ditunjukkan oleh klasifikasi efisien dari mikroorganisme.

Taksonomi memiliki tiga komponen: tata nama, klasifikasi dan identifikasi. Nomenklatur hanya memberi nama pada suatu spesies. Klasifikasi adalah pengelompokan spesies bersama-sama menurut karakteristik bersama - beberapa di antaranya adalah fisik, dan beberapa biokimia. Identifikasi menggunakan ciri-ciri suatu organisme untuk menentukan tempatnya dalam skema klasifikasi. Skema taksonomi modern memiliki kelompok terbesar dan paling inklusif, domain. Kelompok terkecil adalah spesies. Dari yang paling inklusif hingga yang paling spesifik, tingkatannya berjalan seperti: domain, kingdom, filum, kelas, ordo, famili, genus, dan spesies. Anda, misalnya, adalah Eukarya Animalia Chordata Mamalia Primata Hominidae Homo sapiens.

Mikroorganisme sangat beragam. Mereka tidak ditentukan oleh jenis struktur atau fungsi tertentu, tetapi hanya oleh ukurannya. Mikroorganisme sangat beragam sehingga mereka termasuk dalam ketiga klasifikasi tingkat atas yang berbeda -- ketiga domain tersebut. Satu domain adalah bakteri, yang lainnya adalah archaea dan yang terakhir adalah eukarya. Semua anggota domain bakteri dan archaea adalah mikroorganisme bersel tunggal. Keduanya adalah sel tanpa membran yang memisahkan materi genetik mereka dari bagian sel lainnya -- membran yang menentukan nukleus. Jadi semua kingdom, filum, kelas, ordo, famili, genera, dan spesies dalam domain bakteri dan archaea adalah mikroorganisme.

Eukarya adalah organisme yang selnya mengandung inti. Banyak organisme eukariotik adalah mikroorganisme bersel tunggal, tetapi banyak lainnya -- seperti pohon redwood, atau Anda -- tidak. Jadi klasifikasi tambahan diperlukan. Kingdom Protista dalam domain Eukarya hanya terdiri dari mikroorganisme bersel tunggal. Protista dipisahkan menjadi tiga kelompok filum yang berbeda: empat filum alga yang berbeda, empat filum protozoa yang berbeda dan dua filum kapang yang berbeda. Tetapi semua organisme dalam filum ini -- semuanya dalam kingdom Protista -- adalah mikroorganisme.

Kingdom Fungi termasuk dalam domain Eukarya. Beberapa filum dalam Fungi mengandung mikroorganisme. Misalnya, filum Zygomycota mengandung jamur roti mikroskopis, dan filum Ascomycota mengandung ragi, serta mikroba hama dan parasit tanaman. Lumut adalah rakitan simbiosis jamur dan organisme fotosintesis -- sebagian terdapat dalam kingdom Fungi dan sebagian di kingdom lain, atau bahkan domain lain.