A kétszálú DNS szerkezete univerzális minden élő sejtben, de eltérések tapasztalhatók a genomi DNS állati és növényi sejtekből történő kinyerésének módszereiben. Noha a genomi DNS a sejtek magjában él, a kivont DNS mennyisége és tisztasága a sejt típusától és méretétől függ. Például bizonyos sejtek több DNS-t és szennyeződést tartalmaznak, mint mások. Olvassa el, hogy többet megtudjon a DNS-extrakció különbségeiről.
Általános DNS-kivonás
Ha a növényi és állati sejteket szappanos anyaggal kezeli, az lebontja a sejt és a sejtmembrán lipidjeit. Ezután a DNS-keverék elválik a sejtmembránoktól és a fehérjéktől. Ezután alkohollal kicsaphatja a DNS-t az oldatban. A mintában lévő mennyiségtől függően a DNS szabad szemmel látható lehet. Ne feledje azonban, hogy ez az egyszerű eljárás nem feltétlenül eredményez nagy tisztaságú DNS-t.
Növényi és állati sejtek
A növényi sejtek merev sejtfaluk és organelláik, például a kloroplaszt miatt különböznek az állati sejtektől. Fehérjéket és enzimeket is tartalmaznak, amelyek szerepet játszanak a fotoszintézisben. Egyes növényi sejtekben poliploidia van, vagyis sejtenként több mint egy kromoszóma van. Ezenkívül a növényekben előforduló sejtes folyamatok, például a fotoszintézis, számos másodlagos metabolitot termelnek. Az állati sejteknek nincs sejtfala, de még mindig szükségük van olyan vegyi anyagokra, mint a nátrium-dodecil-szulfát (SDS), hogy megzavarják a sejtmembránt és felszabadítsák a genomi DNS-t.
Növényi DNS-kivonás
A növényi genom DNS-t a növény sejtfala miatt nehezebb kinyerni. Homogenizálással vagy celluláz hozzáadásával eltávolíthatja a sejtfalat alkotó cellulóz lebontását. Ezenkívül a növényi sejtben jelen lévő metabolitok megzavarhatják a genomiális DNS-extrakciót azáltal, hogy a kicsapási folyamat során szennyezik a DNS-mintát.
Állati DNS kivonása
A perifériás vér leukocitái az állati genom DNS fő forrása, de a mintagyűjtés nehéz, mert a vérnek közvetlenül az állatból kell származnia. A vér számos olyan vegyületet tartalmaz, mint fehérjék, lipidek, fehérvérsejtek, vörösvértestek, vérlemezkék és plazma, amelyek szennyezhetik a DNS-mintát. A vérmintákból kivont állati DNS elsődleges szennyezője azonban a hem, amely a hemoglobin nem fehérje komponense.
A DNS-különbségek
A növényi és állati DNS közötti különbségek a spirál bázisainak sorrendjében rejlenek. A növényi sejtekben található vegyületek nincsenek az állati sejtekben, és a DNS-bázis szekvenciák ezt tükrözik. A genomi növényi DNS gyakran nagyobb, mint az állati DNS. Ezek a különbségek befolyásolják az extrakciós módszereket, a hozamot és a DNS tisztaságát is.