A géntechnológiával módosított növények közé tartoznak a kukorica, a gyapot és a burgonya fajtái. Ezeknek a növényeknek a Bacillus thuringiensis (Bt) baktérium génje van beépítve genomjukba. A Bt gén a rovarlárvákat elpusztító toxin szintézisét kódolja. Más növényeket genetikailag módosítottak, hogy ellenálljanak egy adott herbicidnek. Bár ezek a növények potenciálisan táplálhatják a világ növekvő népességét, ugyanakkor komoly kockázatokat jelentenek a szervezetek természetes változatosságára vagy a biológiai sokféleségre nézve.
Gyomirtó szer használata
A herbicidek sok fajra mérgezőek. Ha herbicidet alkalmaznak a mezőgazdasági tájakon, a káros vegyi anyagok a természetes ökoszisztémákba kerülnek. Sokan úgy vélik, hogy a herbicid-rezisztens növények ösztönzik a herbicidek fokozott használatát, és ha több herbicidet használnak, még több vegyszer kerül a természetes rendszerekbe. Ezek a vegyi anyagok megölik az őshonos növényeket, amelyek közvetlenül etetik az állatokat és a kétéltűeket megfertőzik, ami a biodiverzitás csökkenését okozza.
Kiutazás
Amikor a géntechnológiával módosított növényekből származó gének a környezetbe kerülnek, potenciálisan megzavarhatják a természetes növényközösségeket, veszélyeztethetik a biológiai sokféleséget és bekerülhetnek az emberi élelmiszer-ellátásba. 2000 szeptemberében a StarLink emberi fogyasztásra nem engedélyezett Bt kukoricát fedeztek fel az Egyesült Államokban a taco kagylóban. A következő hónapokban a StarLinket különféle sárga kukoricatermékekben is felfedezték, némelyik országon kívül. Eleinte néhány termelőt azzal gyanúsítottak, hogy figyelmen kívül hagyták azokat a megállapodásokat, amelyek nem adják el a StarLink-et malmoknak. A termelőkkel készített interjúkból azonban kiderült, hogy sokan vagy nem kaptak egyértelmű utasításokat nem értékesíti a StarLink-et malmok számára, vagy azt mondták nekik, hogy a nem jóváhagyott fajtát betakarítással jóváhagyják idő. A pontos pontok, amelyeken a StarLink belépett a tápvezetékbe, továbbra sem ismertek, és a Cornell Cooperative Extension A géntechnológiával módosított szervezetek közkiadásainak oktatási projektje az Egyesült Államok kukoricájának több mint felébe behatolhatott kellékek.
Gyomirtó szerekkel szembeni ellenállás
Azok a területek, ahol a növényfajok származnak, különösen ki vannak téve a helyi fajtákkal való kitörésnek. Mexikóban, ahol több mint 100 egyedi kukoricafajta létezik, a géntechnológiával módosított kukorica tilos. A tiltás ellenére génmódosított kukoricából származó géneket találtak a mexikói kukoricában. Növénygenetikusok az U.C. A Riverside kimutatta, hogy számos hagyományos tenyésztésű növényből áramlik a gén növeli a vadon élő rokonok gyomnövénységét, és néhány esetben a növényi növények váltak gyomok. A megnövekedett gyomlálás akkor aggodalomra ad okot, amikor a géntechnológiával módosított növények képesek versenyezni más fajokkal több vetőmag termelésével, a virágpor vagy a vetőmag további diszpergálásával vagy a fajlagos erőteljesebb növekedésével környezetek. A transzgénikus napraforgók 50 százalékkal több magot teremhetnek, mint hagyományos társaik és néhányuk a kutatók aggódnak amiatt, hogy a géntechnológiával módosított növények fokozatosan kiszoríthatják az értékes genetikai anyagokat sokféleség.
Bt Toxin
A géntechnológiával módosított növények által termelt méreganyagok veszélyeztetik a biológiai sokféleséget, és a Sierra Club szerint a géntechnológiát környezeti szempontból veszélyesnek kell tekinteni. A Cornell Egyetem tanulmánya azt mutatja, hogy a Bt toxin elpusztítja a hasznos, nem célzott fajok, például a lepkék és a pillangók lárváit. Hasonló vizsgálatok azt mutatják, hogy csökkent más hasznos fajok, ideértve a csipkeszárnyakat és a katicabogarakat is. A toxin a Bt kukorica gyökérzetében és a növényi maradványokban is fennmarad még jóval a növények betakarítása után és káros következményekkel járhat a talajban élő és fenntartó mikroorganizmusok milliói számára termékenység. Amikor a Bt toxin a talaj részecskéihez kötődik, két-három hónapig fennmaradhat. Ennek negatív hatása lehet a vízi és talaj gerinctelenekre, valamint a baktériumfajokban előforduló tápanyag-ciklus folyamatokra.