Azokat a szervezeteket, amelyek olyan körülmények között élnek, amelyek a legtöbb dolgot károsíthatják vagy megölik, extrémophiloknak nevezzük. Amikor ennek az extrém környezetnek nagyon alacsony a pH-ja, általában három alatt van, akkor ezeket acidofilekként ismerik. Az acidofil baktériumok sokféle helyen élnek, a tenger fenekén lévő szellőzőnyílásoktól kezdve a termikus tulajdonságokig Yellowstone az emberi gyomorhoz, és mindegyikük rendelkezik olyan adaptációkkal, amelyek segítenek túlélni zord, savas körülmények között.
Helicobacter pylori
A Helicobacter pylori olyan baktériumfaj, amely megtalálható az emberi gyomorban és felelős a gyomorfekélyek 80-90 százalékáért (lásd a 3. hivatkozást). Csavar alakú, több zászlóval, amelyek segítik a mozgását. Az emberi gyomor pH-ja akár két is lehet, elég savas ahhoz, hogy denaturálja a fehérjéket, elkezdje emészteni az ételt és elpusztítsa a legtöbb baktériumot. A Helicobacter pylori acidofil, de szívesebben nem töltene energiát azzal, hogy biztonságban tartsa magát a sav káros hatásaival szemben, ezért sok idejét a gyomor nyálka mélyén beásva tölti. Amikor valóban helyről a másikra kell mozognia, védőbuborékos pufferoldattal szigeteli magát, amely semlegesíti a savat.
Thiobacillus acidophilus
A Thiobacillus acidophilus egy példa egy termo-acidofilra, vagyis olyan baktériumra, amely szereti a rendkívül forró és rendkívül savas környezetet egyaránt. A Yellowstone Nemzeti Park savas gejzírmedencéiben található, valamint más helyeken. Azért is érdekes, mert fotoszintézisre képes, vagy energiáját a napból nyeri. A legtöbb acidofil baktériumhoz hasonlóan ez is túlél egy nagyon hatékony protonpumpa használatával, hogy megakadályozza a túl sok hidrogénatom bejutását és a belső pH-érték megváltoztatását.
Acetobacter aceti
A legtöbb acidofil baktérium alkalmazkodást alkalmaz a belső pH semleges tartására, hogy a sav ne denaturálódjon fehérjeik, de az Acetobacter aceti módosította fehérjéit, hogy a savas ne károsítsa őket környezetek. Az alkalmazott környezeti mikrobiológiai vizsgálat során több mint 50 speciális fehérjét találtak, amelyek a baktérium savas körülmények között történő kezelésének elősegítése érdekében fejlődtek ki. Mindez az adaptáció jót tesz az embereknek, mivel ezt a fajt már évezredek óta ecetsav vagy ecet létrehozására használjuk.
Oligotropha corboxydovorans
A mély tengerben, ahol nem hatol be fény, a tengerfenéken lévő termikus szellőzők savat és más mérgező anyagokat szórnak. Ezek a szellőzőnyílások képezik az alapját egy hihetetlen ökoszisztémának. Egy kagyló, amely a termikus szellőzőnyílások között él, rendelkezik szimbiotikus kapcsolat Oligotropha corboxydovorans-szal. A kagyló otthont ad, a baktériumok pedig hidrogént fogyasztanak, hogy energiát termeljenek mindkettőhöz. A hidrogénatomok megsavanyítják a rendszereket, és ezek a baktériumok megtalálták a módját a hidrogén felhasználására és miniatűr üzemanyagcellákká alakítására.