A baktériumok többségét a neutrofil és az acidofil heterotróf baktériumok alkotják. A "neutrofil" és az "acidofil" kifejezések a baktériumfajok pH-jának optimális szintjét jelzik - az anyag savasságának vagy lúgosságának a mértékét. Például az ecet savas, a szódabikarbóna pedig alapul. A pH-skála 0 és 14 között mozog, a közepén 7 a tiszta víz pH-ja.
Neutrofil heterotrófok
A baktériumok, a neutrofilek többsége a talajban vagy a vízben él, és 6–8 közötti semleges pH-n nő a legjobban. Ha a pH-érték túl messze változik ezen a tartományon kívül, akkor a neutrofil baktériumok nem tudnak életben maradni. Az emberekben betegségeket okozó baktériumok többsége szintén neutrofil heterotróf, amely alkalmas arra, hogy túlélje az emberi testet.
Acidofil heterotrófok
Az acidofil baktériumok jobban növekednek alacsonyabb pH-szinteken, általában 6-os pH alatt, mivel olyan biológiai mechanizmusokkal rendelkeznek, amelyek lehetővé teszik belső pH-juk semleges közelében tartását. A savbánya-elvezetés - a szennyezett, erősen savas lefolyás a bányaterületekről - nagyszámú olyan acidofilt tartalmaz, amelyek oxidálják a fémércekben található szulfidot. A Carleton College természettudományi oktatási erőforrásközpontja szerint a savbánya-elvezetésben található acidofil Ferroplasma pH-értéke nulla volt.
Kötelezően acidofil heterotrófok
A kötelező acidofilok túléléséhez alacsony, 4 vagy 5 alatti pH szükséges. A kötelező acidofilok sejtmembránja semleges pH-szinten feloldódik, ami sejthalált okoz. Sok kötelező acidofil egyben termofil is - olyan szervezet, amely magas hőmérsékleten nő a legjobban - és általában vulkanikus talajokban található meg. A Thiobacillus ferrooxidans valószínűleg a leggyakrabban vizsgált vasoxidáló savasofil baktérium.