A nőstény mókusok párzással szaporodnak, majd fiatalon szülnek. Egyéves korukban képesek megkezdeni a párzási folyamatot. Az első párzási időszak tél végén kezdődik, általában február vége körül. Az évad májusig tarthat. A második párzási időszak tavasz végén következik be, és egészen nyár végéig tart. A legtöbb mókusfaj két alommal rendelkezik; egyet tavasz végén és egyet nyár végén. Egyes fajok évente csak keveset viselnek. A mókusokat cicának hívják.
A nőstény mókusok erős illatot árasztanak, amelyet a hím mókus képes észlelni. Amint a hím mókus megérinti a nőstényt, nagy sebességgel üldözi a fák között. Mancsával hangosan megpofozza a fa kérgét is. Ha egynél több hím üldöz egy nőstényt, akkor a hímek is gyakran megpróbálják elűzni egymást. Ez csodálatos akrobatikát eredményez a fák között. A nőstény kiválasztja a legerősebb hímet, akivel párosítani lehet. Ettől a naptól fogva képes lesz felismerni őt, és mindent megtesz, hogy soha többé ne pározzon vele. Párzás után a hím mókus végleg távozik. Semmi köze a cicák neveléséhez.
A mókus átlagos alma két-öt cicából áll. A vemhesség időtartama körülbelül hat hét, bár egyes mókusfajoknál a vemhesség időtartama csak négy hét, másoknál pedig a nyolc hét, például a szürke és a rókamókusnál.
A mókusok vagy cicák születésükkor aprók. Körülbelül egy uncia súlyúak és körülbelül egy hüvelyk hosszúak. Szőrtelenek, fogak nélküliak és szinte vakok az élet első egy-két hónapjában. Azonban gyorsan növekednek, és általában tíz héten át teljesen elválasztják őket. Négy hónapos korukra a mókusok többsége végleg elhagyta anyja fészkét.