Sokféle ökoszisztéma létezik. A vízi ökoszisztémák a világ ökoszisztémáinak nagy részét teszik ki, és édesvízi ökoszisztémákként vagy tengeri ökoszisztémákként sorolhatók be. Bármely típusú ökoszisztéma lakói alkalmazkodni fognak a túléléshez az adott ökoszisztéma által meghatározott feltételek mellett.
Az ökoszisztéma olyan közösség, amelyet összetett kölcsönhatások tartanak össze egy adott területen a biotikus és abiotikus tényezők között. Az ökoszisztéma biotikus tényezői az élő részek, például a növények, állatok, baktériumok és gombák. Az abiotikus tényezők közé tartozik a talaj, a víz és más, a környezetben jelenlévő nem élő elemek. Az ökoszisztéma lehet akkora, mint egy sivatag, vagy olyan kicsi, mint az árapály. Csak annyi élőlény lesz, amennyit az élelmiszer-ellátás támogathat. Az olyan kölcsönhatások, mint a ragadozó-zsákmány és az élelmiszer-webes kapcsolatok, meghatározzák az ökoszisztéma populációját. Minden élőlénynek el kell látnia egy olyan szerepet, amely hozzájárul az ökoszisztéma általános sikeréhez és túléléséhez.
A tengeri kifejezés az óceánokkal kapcsolatos ökoszisztémára utal. A Környezetvédelmi Ügynökség (EPA) szerint a tengeri ökoszisztémák a világ ökoszisztémáinak körülbelül 70 százalékát teszik ki. A tengeri ökoszisztémák egyedülállóak a vízben szuszpendált oldott vegyületek, nevezetesen a só miatt. Olyan apró élőlények, mint a mikroszkopikus plankton és akkora, mint a bálnák, a tengeri ökoszisztémák különféle típusaiban élnek. A tengeri ökoszisztémák közé tartoznak az óceánok, a torkolatok és a sós mocsarak, a korallzátonyok, a mangrove erdők, a lagúnák, a moszatú tengeri fűfenek és az árapály-zóna, amely a strandokra nyúlik.
Sokféle édesvízi ökoszisztéma létezik. A folyók, tavak, tavak és patakok a leggyakoribb édesvízforrások. A víztározókat, vizes élőhelyeket és a talajvíz forrásait édesvízi ökoszisztémának is tekintik. Az édesvízi ökoszisztémák nem tartalmazzák ugyanolyan oldott anyagokat a vízben, mint a tengeri ökoszisztémák, így az ott élő állatok és növények nem élnék túl a tengeri ökoszisztémában. Mivel az édesvíz nem tartalmaz sót, érzékenyebb a fagyásra és az olvadásra. Az édesvízi növények és állatok alkalmazkodtak ahhoz, hogy túléljék ezt a folyamatot. Légzőszerveik is kifejezetten az édesvízhez vannak adaptálva, és olyan szaporodási és táplálkozási magatartásuk alakult ki, amely lehetővé teszi számukra, hogy sikeresen túléljék környezetüket.