Započnite postupak identificiranja nepoznatih bakterija promatrajući njihove fizičke karakteristike, poput stanične stijenke, oblika i veza. Upotrijebite standardne laboratorijske postupke, poput bojenja stanica, uzgoja i sekvenciranja DNA kako biste dodatno suzili vašu identifikaciju. Bakterije se obično grupiraju u vrste prema njihovim fizičkim i metaboličkim karakteristikama, a ne prema genetskom međusobnom odnosu.
Pozitivno ili negativno
Eubakterije su takozvane prave bakterije. Razlikuju se od arheja ili arhebakterija, koje čine zasebno kraljevstvo. Eubakterije su prokarioti, što znači da im nedostaje nuklearna membrana. Većina ima stanične membrane i stanične stijenke. Bakterije s debelim staničnim stijenkama nazivaju se gram-pozitivnima, jer su osjetljive na umiranje tijekom testa nazvanog Gramova mrlja. Gramova mrlja prvi je test koji se koristi u klasifikaciji bakterija. Bakterije s tankim ili odsutnim staničnim stijenkama gram-su negativne, jer ne zarobljavaju boju po Gramu.
Oblikovanje bakterija
Sferne bakterije nazivamo kokcima, bakterije koje tvore ravne šipke nazivaju se bacilima, a bakterije srednjeg oblika kokobacilima. Svi oni mogu biti gram-negativni ili gram-pozitivni. Krute, spiralne bakterije poznate su pod nazivom spirilla i samo su gram-negativne. Fleksibilne, neovisno pokretne bakterije u obliku spirale nazivaju se spirohetama i gram su neutralne. Konačno, krute šipke u obliku zareza nazivaju se vibrioni i gram-negativne su. Nekoliko malo poznatih i slabo razumljivih bakterija ima različite oblike, poput zvijezde u obliku zvijezde i labrija u obliku sjekire. Postoje i dvije srednje bakterijske skupine. Rickettsia su slične virusima, imaju razne oblike, gram-negativne su i mogu preživjeti samo unutar drugih stanica. Mikoplazme, koje su slične gljivicama, nemaju stanične stijenke i uključuju mnoge plućne patogene koji uzrokuju upalu pluća.
Kocke, klasteri i ostale veze
Cocci i bacili dalje se klasificiraju prema vezama koje nastaju nakon diobe stanica. Diplococci i diplobacili se lijepe u parovima. Streptokoki i streptobacili tvore lance. Tetrad koki ostaju na kvadratima od četiri bakterije. Koki Sarcinae tvore kockice s osam bakterija, a stafilokoki grozdove.
Identificiranje bakterija
Ako imate nepoznatu bakteriju i želite je identificirati, obično ćete napraviti mrlju od grama, a zatim promatrati izgled kolonije i pojedinačne značajke. U tom trenutku možete reći da imate, na primjer, gram negativne aerobne streptobacile. Zatim možete usporediti svoj uzorak s raznim poznatim bakterijama stavljanjem na različite kulture kulture poticati rast nekih vrsta i inhibirati druge, ili ispitivanjem uzorka na različite poznate bakterije nusproizvodi. Kao krajnje sredstvo, sekvenciranje DNA može utvrditi imate li poznatu ili nepoznatu bakterijsku vrstu ili soj, pod uvjetom da ga uspoređujete sa vrstom ili sojem čiji je genom već sekvenciran.