Kako izračunati izoelektričnu točku peptida

Peptidi su kratki polimerni fragmenti sastavljeni od aminokiselina. Svaki peptid ima određenu aminokiselinsku sekvencu označenu s troslovnim ili jednoslovnim kodom; na primjer aminokiselina alanin je skraćeno kao "Ala" ili "A." Naboj peptida u otopini ovisi o kiselosti otopine. Izoelektrična točka (pI) odnosi se na vrijednost kiselosti otopine pri kojoj molekula peptida ima neto naboj nula. Topljivost peptida je na izoelektričnoj točki minimalna. Upotrijebite dostupne web poslužitelje za izračun vrijednosti pI za sekvencu peptidnih aminokiselina.

Napiši sekvencu peptida pomoću jednoslovnog koda. Na primjer, ako peptid ima aminokiselinsku sekvencu Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanin-Serin-Glumatična kiselina-Leucin-Prolin), tada je slijed od jednog slova "ASELP". Ako je potrebno, pogledajte tablicu pretvorbe od tri slova u jedno slovo dano u Resursi.

Koristite bilo koji web preglednik, Internet Explorer ili Firefox, na primjer, za navigaciju do poslužitelja koji izračunava izoptičnu točku peptida (pI); vidi Resursi.

Očitajte vrijednost izoelektrične točke (pI) navedenu u retku "Teoretski pI / Mw". U našem primjeru, pI je 4,00. Imajte na umu da poslužitelj također izračunava molekularnu težinu (Mw) peptida.

o autoru

Oxana Fox slobodna je pisac specijalizirala se za medicinu i liječenje, računalni softver i hardver, digitalnu fotografiju i financijske usluge. Diplomirala je na Moskovskom medicinskom fakultetu 1988. godine s formalnom edukacijom iz pedijatrije.

Foto bodovi

Comstock slike / Comstock / Getty Images

  • Udio
instagram viewer