Biljke, alge i razni fitoplanktoni sadrže klorofil u svojim stanicama. Ovaj vitalni dio molekularnog sastava stanica kontrolira proces fotosinteze u organizmu ili biljci. Istraživači često ispituju razinu klorofila u uzorcima površinske vode iz jezera, rijeka i potoka, kao i u biljnom svijetu. Rezultati ispitivanja pokazuju trenutne uvjete i razinu hranjivih sastojaka koji utječu na uzorak.
Mjerenje razine klorofila pomaže u određivanju stanja organizma i kakvoće vode. Visoke razine klorofila obično ukazuju na to da je uzorak bogat hranjivim tvarima, obično dušikom i fosforom. Nenormalno niske razine klorofila ukazale bi na moguće onečišćenje, curenje septičkog sustava ili otjecanje na tom području. Obično se uzorci prikupljaju i uspoređuju s vremenom kako bi se pratile promjene na području uzorka.
Spektrofotometrija i tekućinska kromatografija visokih performansi (HPLC) dvije su metode korištene za mjerenje količine klorofila u uzorku vode. Voda se sakuplja i filtrira kako bi se izolirali organizmi koji sadrže klorofil. Stanice ovih organizama puknu da bi izdvojile klorofil. Sakupljeni uzorak stavi se u otopinu acetona. Uzorak se analizira spektrofotometrijom ili HPLC metodom. Spektrofotometrija uključuje ispitivanje upijajućih ili fluorescentnih svojstava klorofila. Uzorak se također može analizirati HPLC metodom. Dvije laboratorijske metode ispitivanja mjere fluorescentne mogućnosti uzorka. Uzorci su izloženi određenoj valnoj duljini svjetlosti (obično 663 i 645 nm), zbog čega klorofil reagira emitirajući veću valnu duljinu.
Pomoću mjerača možete testirati razinu klorofila, obično živih biljaka. Na površini uzorka sjaju dva LED svjetla, najvjerojatnije biljni list. Crveno LED svjetlo ima vršnu valnu duljinu od 650 nm, a infracrveno LED na vrhuncu od 940 nm. Dio svjetlosti apsorbira klorofil; ostatak se apsorbira kroz uzorak. Udio klorofila u ostalim mjerama uzorka izračunava se unutar metra i prikazuje kao proizvoljna jedinica između 0 i 199.