Honduras je druga po veličini država u Srednjoj Americi, proteže se preko prevlake od Kariba do Tihog oceana. Unatoč agresivnoj krčenju šuma, Honduras i dalje održava više pošumljenog područja od većine drugih zemalja u regiji. Nekoliko vrsta šuma dominira krajolikom, uključujući oblačnu šumu, borovu šumu, kišnu šumu i mangrove. Biljne i životinjske vrste obiluju raznolikim šumskim ekosustavima Hondurasa, uključujući vrste koje su nestale iz ostatka regije. Više od jednog utočišta za divlje životinje u Hondurasu izdvojeno je za zaštitu raznolikosti života na tom području.
Sisavci u Hondurasu
Više od 200 vrsta sisavaca nalazi se u šumama Hondurasa. Nekoliko rijetkih stvorenja uključeno je među životinje u Hondurasu. Šišmiši (Chiroptera) čine gotovo polovicu sisavaca u zemlji, a 98 poznatih vrsta zauzima svaki šumski ekosustav. Znameniti jaguar (Panthera onca) jedna je od najrjeđih vrsta u cijeloj Srednjoj Americi. Najčešće se viđaju u područjima mangrova, jaguari su ugrožena vrsta u Hondurasu. Zapadnoindijske morske krave (Trichechus manatus), nekada uobičajene uz karipsku obalu Hondurasa, danas se rijetko mogu vidjeti, osim u udaljenim područjima mangrove. Nacionalna životinja Hondurasa, bjelorepi jelen (Odocoileus virginianus), najveća je vrsta jelena u zemlji. Bijeli rep, najčešće viđen u nizinama i borovim šumama, zaštićena je vrsta. Širok izbor majmuna nalazi se i u Hondurasu, uključujući kapucina bijele glave (Cebus capucinus), Meksički majmun pauk (Ateles geoffroyi vellerosus) i majmun zavijajući zlatom ogrtačem (Alouatta palliata palliata).
Obilje ptica
Honduras ima izuzetno bogatu raznolikost vrsta ptica. Postoji 18 vrsta papiga, uključujući narančasto-pahuljicu (Brotogeris jugularis), veliku zelenu ara (Ara ambigua), tihookeanski papagaj (Aratinga strenua) i grimizna ara (Ara macao), koja je nacionalna ptica Hondurasa. Nađena u tropskim šumama na visokim nadmorskim visinama, lastavica s crnim kapama (Notiochelidon pileata) ptica je selica uobičajena u Hondurasu. Kesten-mandibulirani tukan (Ramphastos swainsonii) čest je prizor u obalnim nizinskim šumama Hondurasa. Poznati po svom jarko obojenom licu i pretjeranom novcu, ponekad ih drže kao kućne ljubimce, iako su zaštićena vrsta.
Tropsko drveće
Svaki šumski ekosustav ima ključnu vrstu, što znači da jedna vrsta definira vrstu šume. U Hondurasu stabla crne mangrove (Avicennia germinans) i crvena mangrova (Rhizopora mangle) ukazuju na granice ekosustava mangrove. Stabla mahagonija (Swietenia macrophylla) ponekad se miješaju s vrstama mangrova na suhom, što ukazuje na početak obalnih nizinskih borovih šuma. Honduraski bor (Pinus caribaea var. hondurensis) i ocote bor (Pinus oocarpa) jedine su dvije vrste bora u zemlji, iako dominiraju golemim područjima nizinske šume. Jedno od najimpresivnijih stabala u Hondurasu je ceiba (Ceiba pentandra). Ponekad se naziva i kapok, to je masivno stablo koje može doseći visinu od 250 stopa s deblom promjera 10 stopa.
Cvjetnice
Vegetacija Hondurasa vrlo je bogata. Znanstvenici procjenjuju da u Hondurasu postoji više od 5000 vrsta biljaka. Cvjetnice obiluju većinom područja zemlje, gdje pružaju hranu za insekte i ptice. Jedna od najplodnijih biljnih vrsta u Hondurasu je kadulja (Salvia). Kadulja breskve (Salvia dorisiana), kadulja Karwinskog (S. karwinskii) i kadulja plave vinove loze (Salvia cacaliifolia) sve su grmolike, višegodišnje vrste koje cvjetaju u hladnim, planinskim šumama središnjeg Hondurasa. Nekada izvor hrane za autohtone ljude, žuti lotos (Nelumbo lutea) jedna je od rijetkih cvjetnica koja se nalazi u šumama mangrove. Poznat po žutim cvjetovima u obliku čaše, često se uzgaja u vodenim vrtovima kao ukrasna biljka.