Sve počinje od korijena. Biljke dobivaju hranjive sastojke iz dva različita sustava - jedan započinje u lišću i odgovoran je za fotosintezu. Drugi započinje od korijena i kroz biljku pomiče vodu napunjenu otopljenim ionima. Proteini su jedna od hranjivih tvari koje započinju od korijena i rade prema gore.
Biljke su autotrofi
Biljke su autotrofi. Za razliku od životinja, koje hranu moraju dobivati iz vanjskih izvora, poput biljaka i drugih životinja, biljke su sposobne proizvesti vlastitu. Biljke uzimaju osnovne elemente iz vanjskog svijeta i unose ih u svoja tijela, gdje se pretvaraju u škrob i proteine koje biljka može koristiti ili životinja koja je jede.
Dušik i bakterije
Proteini su napravljeni od nitrata, oblika dušika koji su fiksirali mikroorganizmi. Biljke ne mogu izravno koristiti dušik, pa se oslanjaju na bakterije da pretvore dušik u oblik koji mogu koristiti. Te bakterije borave u blizini korijena biljaka ili u posebnim strukturama na korijenju koje se nazivaju kvržice. Bakterije u čvorićima stvorile su simbiotski odnos s biljkama gdje iz biljke razmjenjuju korisni dušik za šećer.
Nitrati i aminokiseline
Nitrati uneseni u biljku kroz korijenje uvlače se u biljku, gdje se pretvaraju u 20 različitih vrsta aminokiselina. Te su aminokiseline pretvorene u proteine u posebnim strukturama u stanicama koje se nazivaju ribosomi. Te se strukture nalaze na četiri mjesta u pogonu. Neki plutaju slobodno u citoplazmi stanica, dok su drugi pričvršćeni za površinu endoplazmatskog retikuluma, mitohondrije i kloroplaste.
Transport proteina
Iz ribosoma sadržanih u endoplazmatskom retikulumu, proteini se šalju u golgijev aparat. Aparat golgi sortira te proteine za distribuciju kroz biljku, gdje će se koristiti za stvaranje novih struktura za daljnji transport hranjivih sastojaka, kao i osnovne metaboličke procese.