एक फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ विकासवादी संबंधों का एक ग्राफिक प्रतिनिधित्व है जो दर्शाता है कि जीव संभवतः एक सामान्य पूर्वज से कैसे अलग हो सकते हैं। पहले, यह जीवित जीवों और जीवाश्मों के शरीर रचना विज्ञान और शरीर विज्ञान की तुलना के माध्यम से किया जाता था, लेकिन अब डीएनए न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमों से ली गई आनुवंशिक जानकारी का आमतौर पर उपयोग किया जाता है। कुछ समानता वाले जीव एक फाईलोजेनेटिक पेड़ की अलग "शाखाओं" पर पाए जा सकते हैं और विशिष्ट समानता वाले जीव उसी शाखा की "टहनियों" पर स्थित होंगे। एक फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ जीवों में प्रजातियों और विकासवादी परिवर्तनों को समझने की एक विधि है।
संबंध तुलना के लिए एक मॉडल जीव का चयन करें। यह एक प्रजाति, नस्ल या न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम के साथ किया जा सकता है जो एक जीव का प्रतिनिधित्व करता है। एक उदाहरण जीव गाय हो सकता है। बाकी पेड़ यह प्रदर्शित करेंगे कि आनुवंशिक लक्षणों के आधार पर गाय अन्य जीवों से कितनी निकटता से संबंधित है।
एक आउटग्रुप चुनें। एक आउटग्रुप एक कम निकट से संबंधित जीव या बहुत अलग न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम है। यदि मॉडल जीव एक गाय है, तो एक संभावित आउटग्रुप एक मछली होगी। जितने अधिक भिन्न दो जीव होंगे, फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ पर उतना ही नीचे उनका विचलन शाखा बिंदु होगा। समय को चार्ट के निचले भाग में सबसे पुरानी तिथि और चार्ट के शीर्ष पर वर्तमान दिन के रूप में दर्शाया गया है। शाखाओं का स्थान लगभग दिखाता है कि अतीत में एक विकासवादी विशेषता ने संभवतः एक पैतृक जीव को विभिन्न प्रजातियों में बदल दिया था।
तुलना के लिए उपयोग की जाने वाली विशेषताओं का एक सेट निर्धारित करें। उदाहरणों में शामिल हैं "चार पैर हैं," "कुड चबाना," "जीवित जन्म देता है" या "बाल बढ़ता है।" न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम उचित हैं डीएनए का वर्णानुक्रमिक निरूपण जो विशेषताओं को निर्धारित करता है, इसलिए एक अन्य विकल्प होगा: "इसमें अनुक्रम शामिल है" एटीजीजीएसीएसीजीजीए।"
विशेषताओं के आधार पर जीवों को विभाजित करें। जब एक जीव में वांछित गुण नहीं होता है, तो फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ में एक शाखा बनाई जाती है। विशेषता के लिए "चार पैर हैं," गाय, भेड़ और हिरण सभी एक शाखा पर होंगे, जबकि मछली एक अलग शाखा पर होगी। पोस्टर बोर्ड के ऊपरी कोने में गाय का चित्र या अनुक्रम चिपकाएँ और मछली को विपरीत कोने में चिपकाएँ और उनसे दो रेखाएँ कागज के आधार पर एक प्रतिच्छेदित V आकार में खींचे।
मॉडल जीवों या न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमों को तब तक अलग करना जारी रखें जब तक कि प्रत्येक उदाहरण में शाखा से एक टहनी में एक ही अलगाव न हो। विशेषता "ऊन है" भेड़ को हिरण और गायों से एक विलक्षण शाखा पर अलग करती है। भेड़ की छवि को मछली की तस्वीर के पास रखें और एक रेखा खींचें जो वी आकार में गाय की शाखा से जुड़ती है। "शराबी पूंछ वाली" विशेषता का उपयोग करके गाय को हिरण से अलग कर दिया जाएगा। गाय और भेड़ के बीच हिरण की तस्वीर चिपकाएं और एक अन्य रेखा को वी आकार में बनाएं जो मछली और भेड़ की रेखाओं के ऊपर प्रतिच्छेद करे। जब प्रत्येक प्रजाति की एक ही शाखा होती है, तो फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ पूरा हो गया है।