पौधों, शैवाल और विभिन्न फाइटोप्लांकटन में उनकी कोशिकाओं के भीतर क्लोरोफिल होता है। कोशिकाओं की आणविक संरचना का यह महत्वपूर्ण हिस्सा जीव या पौधे के भीतर प्रकाश संश्लेषण प्रक्रिया को नियंत्रित करता है। शोधकर्ता अक्सर झीलों, नदियों और नालों के सतही जल के नमूनों के साथ-साथ पौधों के जीवन में क्लोरोफिल के स्तर का परीक्षण करते हैं। परीक्षण के परिणाम वर्तमान परिस्थितियों और पोषक तत्वों के स्तर को इंगित करते हैं जो नमूने को प्रभावित कर रहे हैं।
क्लोरोफिल के स्तर को मापने से जीव की स्थिति और पानी की गुणवत्ता निर्धारित करने में मदद मिलती है। क्लोरोफिल के उच्च स्तर आमतौर पर संकेत देते हैं कि नमूना पोषक तत्वों में उच्च है, आमतौर पर नाइट्रोजन और फॉस्फोरस। क्लोरोफिल का असामान्य रूप से निम्न स्तर क्षेत्र में संभावित प्रदूषण, सेप्टिक सिस्टम रिसाव या अपवाह का संकेत देगा। नमूना क्षेत्र में परिवर्तनों को ट्रैक करने के लिए आमतौर पर नमूने एकत्र किए जाते हैं और समय के साथ तुलना की जाती है।
स्पेक्ट्रोफोटोमेट्री और उच्च-प्रदर्शन तरल क्रोमैटोग्राफी (एचपीएलसी) पानी के नमूने में क्लोरोफिल की मात्रा को मापने के लिए उपयोग की जाने वाली दो विधियां हैं। क्लोरोफिल युक्त जीवों को अलग करने के लिए पानी एकत्र और फ़िल्टर किया जाता है। क्लोरोफिल निकालने के लिए इन जीवों की कोशिकाओं को तोड़ दिया जाता है। एकत्रित नमूना एसीटोन समाधान में रखा गया है। नमूने का विश्लेषण या तो स्पेक्ट्रोफोटोमेट्री या एचपीएलसी विधि द्वारा किया जाता है। स्पेक्ट्रोफोटोमेट्री में क्लोरोफिल के अवशोषण या फ्लोरोसेंट गुणों को देखना शामिल है। नमूने का विश्लेषण एचपीएलसी विधि द्वारा भी किया जा सकता है। परीक्षण के दो प्रयोगशाला तरीके नमूने की फ्लोरोसेंट क्षमताओं को माप रहे हैं। नमूने प्रकाश की एक निश्चित तरंग दैर्ध्य (आमतौर पर 663 और 645 एनएम) के संपर्क में आते हैं, जो उच्च तरंग दैर्ध्य का उत्सर्जन करके क्लोरोफिल प्रतिक्रिया करता है।
आप आमतौर पर जीवित पौधों के क्लोरोफिल के स्तर का परीक्षण करने के लिए एक मीटर का उपयोग कर सकते हैं। नमूने की सतह पर दो एलईडी लाइटें चमकती हैं, सबसे अधिक संभावना है कि एक पौधे का पत्ता। लाल एलईडी लाइट में 650 एनएम की चरम तरंग दैर्ध्य और 940 एनएम की चोटी पर अवरक्त एलईडी है। प्रकाश का कुछ भाग क्लोरोफिल द्वारा अवशोषित कर लिया जाता है; शेष पूरे नमूने में अवशोषित हो जाता है। नमूने के अन्य उपायों के लिए क्लोरोफिल के अनुपात की गणना मीटर के भीतर की जाती है और इसे 0 और 199 के बीच एक मनमानी इकाई के रूप में प्रदर्शित किया जाता है।