Comment calculer les interférences

Le croisement chromosomique, également appelé croisement génétique, est un processus normal par lequel les gènes se recombinent. La recombinaison augmente la variation génétique en se recombinant pour produire différents traits.

TL; DR (trop long; n'a pas lu)

L'interférence génique est une mesure de l'indépendance des croisements les uns par rapport aux autres. Si un croisement dans une région affecte un croisement dans une autre région, cette interaction est appelée interférence. Interférence = 1 − c.o.c., où c.o.c. est le coefficient de coïncidence (c.o.c.)

Les humains ont 23 chromosomes. Au cours de la méiose, une cellule se divise deux fois pour former quatre cellules filles. Ces quatre cellules filles ont la moitié du nombre de chromosomes de la cellule mère. Ils peuvent ensuite se joindre à une autre moitié chromosomique de l'ovule ou du sperme pour former une paire entière.

Parfois, ces deux parties ne restent pas ensemble. Si les morceaux se cassent, ils peuvent alors se joindre à un autre morceau cassé. Les deux copies génétiques qui se recombinent sont appelées chromatides. Des problèmes tels que le syndrome de Down ou d'autres troubles génétiques peuvent être causés lorsque les gènes se combinent de manière incorrecte.

La plupart des croisements se produisent normalement. Parfois, un double croisement se produit. C'est à ce moment que les chromatides se rejoignent en deux points au lieu d'un. Au deuxième point de contact, les chromatides peuvent à nouveau se séparer et échanger à nouveau des informations génétiques.

L'interférence génique est une mesure de l'indépendance des croisements les uns par rapport aux autres. En d'autres termes, puisque vous savez que les doubles croisements se produisent, vous devez répondre à la question de savoir si les croisements dans les régions chromosomiques adjacentes sont indépendants ou non. S'ils ne sont pas indépendants, cela signifie qu'un croisement dans une région affecte la probabilité qu'il y ait un croisement dans une région adjacente. Si un croisement dans une région affecte un croisement dans une autre région, cette interaction est appelée interférence.

Comment calculer les interférences

Lorsque l'on considère comment calculer l'interférence, la première étape consiste à calculer le coefficient de coïncidence (c.o.c.). Le c.o.c. dépend à son tour de la probabilité d'un double croisement, appelée valeur de fréquence de croisement, également connue sous le nom de "fréquence des doubles recombinants".

Le coefficient de coïncidence est le rapport entre les doubles recombinants observés et attendus.

Coefficient de coïncidence = fréquence observée des doubles recombinants / fréquence attendue des doubles recombinants

Le nombre attendu de doubles recombinants dans un échantillon de deux régions indépendantes est égal au produit des fréquences de recombinants dans les régions adjacentes.

L'interférence est alors définie comme suit :

interférence = 1 − c.o.c.

L'interférence vous indique à quel point un croisement dans l'une des régions d'ADN interfère avec la formation d'un croisement dans l'autre région.

Si l'interférence est nulle, cela signifie que les doubles croisements se produisent comme prévu et qu'un croisement dans une région se produit indépendamment d'un croisement dans une région adjacente.

Si l'interférence est 1, cela signifie que l'interférence est complète et qu'aucun double croisement n'est observé parce qu'un croisement dans une région élimine la probabilité d'un croisement dans une région adjacente Région.

En règle générale, vos données afficheront une interférence comprise entre 0 et 1. Les valeurs supérieures à zéro mais inférieures à un indiquent qu'une interférence se produit.

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